Protein–RNA interactions for Protein: P25322

Ccnd1, G1/S-specific cyclin-D1, mousemouse

Predictions only

Length 295 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccnd1P25322 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ccnd1P25322 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ccnd1P25322 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ccnd1P25322 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ccnd1P25322 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ccnd1P25322 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ccnd1P25322 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ccnd1P25322 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ccnd1P25322 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ccnd1P25322 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ccnd1P25322 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ccnd1P25322 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ccnd1P25322 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ccnd1P25322 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Ccnd1P25322 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ccnd1P25322 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ccnd1P25322 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ccnd1P25322 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ccnd1P25322 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ccnd1P25322 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ccnd1P25322 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ccnd1P25322 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ccnd1P25322 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ccnd1P25322 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ccnd1P25322 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ccnd1P25322 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ccnd1P25322 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ccnd1P25322 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ccnd1P25322 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ccnd1P25322 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ccnd1P25322 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ccnd1P25322 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Ccnd1P25322 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ccnd1P25322 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ccnd1P25322 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ccnd1P25322 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Ccnd1P25322 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ccnd1P25322 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ccnd1P25322 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ccnd1P25322 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ccnd1P25322 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ccnd1P25322 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ccnd1P25322 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ccnd1P25322 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ccnd1P25322 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ccnd1P25322 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Ccnd1P25322 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ccnd1P25322 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ccnd1P25322 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ccnd1P25322 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ccnd1P25322 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ccnd1P25322 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Ccnd1P25322 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ccnd1P25322 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ccnd1P25322 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ccnd1P25322 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ccnd1P25322 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ccnd1P25322 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ccnd1P25322 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ccnd1P25322 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ccnd1P25322 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ccnd1P25322 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ccnd1P25322 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ccnd1P25322 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ccnd1P25322 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Ccnd1P25322 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ccnd1P25322 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ccnd1P25322 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ccnd1P25322 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ccnd1P25322 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Ccnd1P25322 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ccnd1P25322 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ccnd1P25322 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ccnd1P25322 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ccnd1P25322 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ccnd1P25322 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ccnd1P25322 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Ccnd1P25322 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ccnd1P25322 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ccnd1P25322 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ccnd1P25322 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ccnd1P25322 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ccnd1P25322 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ccnd1P25322 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ccnd1P25322 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ccnd1P25322 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ccnd1P25322 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ccnd1P25322 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ccnd1P25322 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ccnd1P25322 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ccnd1P25322 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ccnd1P25322 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ccnd1P25322 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ccnd1P25322 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ccnd1P25322 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ccnd1P25322 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ccnd1P25322 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ccnd1P25322 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ccnd1P25322 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ccnd1P25322 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.4 ms