Protein–RNA interactions for Protein: P25054

APC, Adenomatous polyposis coli protein, humanhuman

Predictions only

Length 2,843 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APCP25054 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.11
APCP25054 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC22.02■■□□□ 1.11
APCP25054 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
APCP25054 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
APCP25054 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
APCP25054 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
APCP25054 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
APCP25054 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC22■■□□□ 1.11
APCP25054 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
APCP25054 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
APCP25054 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
APCP25054 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
APCP25054 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
APCP25054 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
APCP25054 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
APCP25054 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
APCP25054 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
APCP25054 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
APCP25054 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
APCP25054 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
APCP25054 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
APCP25054 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
APCP25054 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
APCP25054 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
APCP25054 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
APCP25054 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
APCP25054 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
APCP25054 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
APCP25054 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
APCP25054 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
APCP25054 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
APCP25054 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
APCP25054 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
APCP25054 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
APCP25054 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
APCP25054 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
APCP25054 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
APCP25054 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
APCP25054 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
APCP25054 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
APCP25054 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
APCP25054 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
APCP25054 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
APCP25054 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
APCP25054 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
APCP25054 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
APCP25054 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
APCP25054 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
APCP25054 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
APCP25054 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
APCP25054 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
APCP25054 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
APCP25054 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
APCP25054 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
APCP25054 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
APCP25054 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
APCP25054 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
APCP25054 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
APCP25054 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
APCP25054 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
APCP25054 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
APCP25054 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
APCP25054 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
APCP25054 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
APCP25054 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
APCP25054 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
APCP25054 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
APCP25054 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
APCP25054 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
APCP25054 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
APCP25054 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
APCP25054 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
APCP25054 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
APCP25054 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
APCP25054 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
APCP25054 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
APCP25054 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
APCP25054 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
APCP25054 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
APCP25054 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
APCP25054 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
APCP25054 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
APCP25054 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
APCP25054 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
APCP25054 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
APCP25054 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
APCP25054 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
APCP25054 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
APCP25054 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
APCP25054 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
APCP25054 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
APCP25054 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
APCP25054 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
APCP25054 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
APCP25054 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
APCP25054 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
APCP25054 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
APCP25054 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
APCP25054 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
APCP25054 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
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