Protein–RNA interactions for Protein: P23979

Htr3a, 5-hydroxytryptamine receptor 3A, mousemouse

Predictions only

Length 487 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Htr3aP23979 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Htr3aP23979 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Htr3aP23979 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Htr3aP23979 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Htr3aP23979 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Htr3aP23979 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Htr3aP23979 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Htr3aP23979 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Htr3aP23979 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Htr3aP23979 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Htr3aP23979 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Htr3aP23979 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Htr3aP23979 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Htr3aP23979 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Htr3aP23979 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Htr3aP23979 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Htr3aP23979 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Htr3aP23979 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Htr3aP23979 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Htr3aP23979 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Htr3aP23979 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Htr3aP23979 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Htr3aP23979 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Htr3aP23979 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Htr3aP23979 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Htr3aP23979 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Htr3aP23979 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Htr3aP23979 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Htr3aP23979 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Htr3aP23979 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Htr3aP23979 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Htr3aP23979 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Htr3aP23979 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Htr3aP23979 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Htr3aP23979 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Htr3aP23979 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Htr3aP23979 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Htr3aP23979 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Htr3aP23979 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Htr3aP23979 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Htr3aP23979 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Htr3aP23979 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Htr3aP23979 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Htr3aP23979 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Htr3aP23979 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Htr3aP23979 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Htr3aP23979 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Htr3aP23979 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Htr3aP23979 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Htr3aP23979 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Htr3aP23979 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Htr3aP23979 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Htr3aP23979 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Htr3aP23979 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Htr3aP23979 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Htr3aP23979 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Htr3aP23979 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Htr3aP23979 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Htr3aP23979 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Htr3aP23979 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Htr3aP23979 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Htr3aP23979 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Htr3aP23979 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Htr3aP23979 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Htr3aP23979 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Htr3aP23979 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Htr3aP23979 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Htr3aP23979 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Htr3aP23979 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Htr3aP23979 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Htr3aP23979 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Htr3aP23979 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Htr3aP23979 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Htr3aP23979 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Htr3aP23979 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Htr3aP23979 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Htr3aP23979 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Htr3aP23979 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Htr3aP23979 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Htr3aP23979 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Htr3aP23979 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Htr3aP23979 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Htr3aP23979 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Htr3aP23979 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Htr3aP23979 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Htr3aP23979 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Htr3aP23979 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Htr3aP23979 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Htr3aP23979 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Htr3aP23979 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Htr3aP23979 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Htr3aP23979 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Htr3aP23979 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Htr3aP23979 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Htr3aP23979 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Htr3aP23979 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Htr3aP23979 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Htr3aP23979 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Htr3aP23979 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Htr3aP23979 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.6 ms