Protein–RNA interactions for Protein: P23434

GCSH, Glycine cleavage system H protein, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 173 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCSHP23434 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
GCSHP23434 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
GCSHP23434 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.5
GCSHP23434 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
GCSHP23434 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
GCSHP23434 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
GCSHP23434 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
GCSHP23434 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
GCSHP23434 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
GCSHP23434 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GCSHP23434 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
GCSHP23434 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
GCSHP23434 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
GCSHP23434 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GCSHP23434 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GCSHP23434 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GCSHP23434 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
GCSHP23434 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GCSHP23434 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GCSHP23434 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GCSHP23434 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GCSHP23434 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
GCSHP23434 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
GCSHP23434 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
GCSHP23434 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
GCSHP23434 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
GCSHP23434 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
GCSHP23434 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GCSHP23434 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GCSHP23434 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
GCSHP23434 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
GCSHP23434 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GCSHP23434 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
GCSHP23434 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
GCSHP23434 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
GCSHP23434 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
GCSHP23434 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
GCSHP23434 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
GCSHP23434 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
GCSHP23434 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GCSHP23434 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
GCSHP23434 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GCSHP23434 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GCSHP23434 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GCSHP23434 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
GCSHP23434 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
GCSHP23434 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
GCSHP23434 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
GCSHP23434 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GCSHP23434 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
GCSHP23434 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
GCSHP23434 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GCSHP23434 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
GCSHP23434 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
GCSHP23434 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GCSHP23434 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
GCSHP23434 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GCSHP23434 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GCSHP23434 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
GCSHP23434 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GCSHP23434 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GCSHP23434 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GCSHP23434 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GCSHP23434 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GCSHP23434 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GCSHP23434 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GCSHP23434 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GCSHP23434 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GCSHP23434 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GCSHP23434 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GCSHP23434 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GCSHP23434 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GCSHP23434 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
GCSHP23434 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GCSHP23434 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GCSHP23434 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GCSHP23434 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GCSHP23434 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GCSHP23434 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GCSHP23434 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
GCSHP23434 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
GCSHP23434 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
GCSHP23434 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GCSHP23434 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GCSHP23434 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GCSHP23434 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GCSHP23434 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GCSHP23434 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GCSHP23434 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GCSHP23434 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GCSHP23434 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GCSHP23434 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GCSHP23434 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GCSHP23434 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GCSHP23434 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GCSHP23434 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
GCSHP23434 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
GCSHP23434 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
GCSHP23434 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
GCSHP23434 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 137.5 ms