Protein–RNA interactions for Protein: P23193

TCEA1, Transcription elongation factor A protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 301 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCEA1P23193 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TCEA1P23193 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TCEA1P23193 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
TCEA1P23193 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
TCEA1P23193 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
TCEA1P23193 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
TCEA1P23193 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TCEA1P23193 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
TCEA1P23193 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TCEA1P23193 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TCEA1P23193 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TCEA1P23193 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TCEA1P23193 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
TCEA1P23193 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
TCEA1P23193 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
TCEA1P23193 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TCEA1P23193 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TCEA1P23193 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TCEA1P23193 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
TCEA1P23193 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TCEA1P23193 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TCEA1P23193 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TCEA1P23193 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TCEA1P23193 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TCEA1P23193 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TCEA1P23193 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TCEA1P23193 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TCEA1P23193 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TCEA1P23193 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TCEA1P23193 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TCEA1P23193 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TCEA1P23193 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TCEA1P23193 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TCEA1P23193 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TCEA1P23193 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TCEA1P23193 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TCEA1P23193 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
TCEA1P23193 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
TCEA1P23193 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
TCEA1P23193 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
TCEA1P23193 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
TCEA1P23193 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TCEA1P23193 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TCEA1P23193 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TCEA1P23193 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
TCEA1P23193 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TCEA1P23193 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TCEA1P23193 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TCEA1P23193 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TCEA1P23193 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TCEA1P23193 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TCEA1P23193 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TCEA1P23193 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TCEA1P23193 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TCEA1P23193 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
TCEA1P23193 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TCEA1P23193 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TCEA1P23193 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
TCEA1P23193 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
TCEA1P23193 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TCEA1P23193 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TCEA1P23193 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TCEA1P23193 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TCEA1P23193 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TCEA1P23193 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
TCEA1P23193 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TCEA1P23193 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TCEA1P23193 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TCEA1P23193 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TCEA1P23193 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TCEA1P23193 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TCEA1P23193 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TCEA1P23193 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TCEA1P23193 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TCEA1P23193 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TCEA1P23193 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TCEA1P23193 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TCEA1P23193 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TCEA1P23193 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TCEA1P23193 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TCEA1P23193 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TCEA1P23193 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TCEA1P23193 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TCEA1P23193 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TCEA1P23193 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TCEA1P23193 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
TCEA1P23193 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
TCEA1P23193 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
TCEA1P23193 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
TCEA1P23193 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
TCEA1P23193 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
TCEA1P23193 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
TCEA1P23193 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
TCEA1P23193 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
TCEA1P23193 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TCEA1P23193 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TCEA1P23193 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TCEA1P23193 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TCEA1P23193 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
TCEA1P23193 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms