Protein–RNA interactions for Protein: P23025

XPA, DNA repair protein complementing XP-A cells, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 273 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XPAP23025 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
XPAP23025 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC25.61■■□□□ 1.69
XPAP23025 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
XPAP23025 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
XPAP23025 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
XPAP23025 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
XPAP23025 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
XPAP23025 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
XPAP23025 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
XPAP23025 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
XPAP23025 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
XPAP23025 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
XPAP23025 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
XPAP23025 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
XPAP23025 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
XPAP23025 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
XPAP23025 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
XPAP23025 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
XPAP23025 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
XPAP23025 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
XPAP23025 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
XPAP23025 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
XPAP23025 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
XPAP23025 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
XPAP23025 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
XPAP23025 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
XPAP23025 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
XPAP23025 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
XPAP23025 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC25.55■■□□□ 1.68
XPAP23025 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
XPAP23025 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
XPAP23025 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
XPAP23025 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
XPAP23025 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
XPAP23025 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
XPAP23025 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
XPAP23025 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
XPAP23025 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
XPAP23025 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
XPAP23025 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
XPAP23025 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
XPAP23025 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC25.52■■□□□ 1.68
XPAP23025 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
XPAP23025 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
XPAP23025 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
XPAP23025 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
XPAP23025 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
XPAP23025 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
XPAP23025 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
XPAP23025 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
XPAP23025 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
XPAP23025 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
XPAP23025 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
XPAP23025 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
XPAP23025 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
XPAP23025 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
XPAP23025 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
XPAP23025 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
XPAP23025 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
XPAP23025 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
XPAP23025 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
XPAP23025 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
XPAP23025 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
XPAP23025 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
XPAP23025 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
XPAP23025 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
XPAP23025 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
XPAP23025 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
XPAP23025 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
XPAP23025 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
XPAP23025 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.67
XPAP23025 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
XPAP23025 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
XPAP23025 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
XPAP23025 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
XPAP23025 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
XPAP23025 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
XPAP23025 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
XPAP23025 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
XPAP23025 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
XPAP23025 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
XPAP23025 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
XPAP23025 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
XPAP23025 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
XPAP23025 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
XPAP23025 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
XPAP23025 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
XPAP23025 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
XPAP23025 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
XPAP23025 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
XPAP23025 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
XPAP23025 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
XPAP23025 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
XPAP23025 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
XPAP23025 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
XPAP23025 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
XPAP23025 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
XPAP23025 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
XPAP23025 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
XPAP23025 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.5 ms