Protein–RNA interactions for Protein: P22670

RFX1, MHC class II regulatory factor RFX1, humanhuman

Predictions only

Length 979 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFX1P22670 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
RFX1P22670 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
RFX1P22670 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
RFX1P22670 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC27.64■■■□□ 2.02
RFX1P22670 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
RFX1P22670 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
RFX1P22670 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
RFX1P22670 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
RFX1P22670 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
RFX1P22670 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
RFX1P22670 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
RFX1P22670 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
RFX1P22670 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
RFX1P22670 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
RFX1P22670 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
RFX1P22670 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
RFX1P22670 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
RFX1P22670 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
RFX1P22670 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
RFX1P22670 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
RFX1P22670 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
RFX1P22670 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
RFX1P22670 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
RFX1P22670 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
RFX1P22670 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
RFX1P22670 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
RFX1P22670 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
RFX1P22670 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
RFX1P22670 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
RFX1P22670 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
RFX1P22670 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
RFX1P22670 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
RFX1P22670 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
RFX1P22670 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
RFX1P22670 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2
RFX1P22670 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC27.57■■■□□ 2
RFX1P22670 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC27.57■■■□□ 2
RFX1P22670 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC27.57■■■□□ 2
RFX1P22670 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
RFX1P22670 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
RFX1P22670 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
RFX1P22670 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
RFX1P22670 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC27.55■■■□□ 2
RFX1P22670 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
RFX1P22670 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
RFX1P22670 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
RFX1P22670 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
RFX1P22670 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
RFX1P22670 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
RFX1P22670 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
RFX1P22670 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
RFX1P22670 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
RFX1P22670 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
RFX1P22670 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC27.52■■■□□ 2
RFX1P22670 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
RFX1P22670 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
RFX1P22670 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
RFX1P22670 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC27.51■■□□□ 1.99
RFX1P22670 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
RFX1P22670 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
RFX1P22670 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
RFX1P22670 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
RFX1P22670 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
RFX1P22670 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
RFX1P22670 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
RFX1P22670 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
RFX1P22670 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
RFX1P22670 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
RFX1P22670 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC27.49■■□□□ 1.99
RFX1P22670 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
RFX1P22670 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
RFX1P22670 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
RFX1P22670 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
RFX1P22670 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
RFX1P22670 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
RFX1P22670 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
RFX1P22670 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
RFX1P22670 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC27.46■■□□□ 1.99
RFX1P22670 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
RFX1P22670 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
RFX1P22670 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
RFX1P22670 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
RFX1P22670 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
RFX1P22670 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
RFX1P22670 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
RFX1P22670 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
RFX1P22670 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
RFX1P22670 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
RFX1P22670 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
RFX1P22670 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
RFX1P22670 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
RFX1P22670 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
RFX1P22670 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
RFX1P22670 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
RFX1P22670 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
RFX1P22670 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
RFX1P22670 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
RFX1P22670 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
RFX1P22670 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
RFX1P22670 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.6 ms