Protein–RNA interactions for Protein: P21952

Pou3f1, POU domain, class 3, transcription factor 1, mousemouse

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Length 449 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pou3f1P21952 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Pou3f1P21952 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Pou3f1P21952 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Pou3f1P21952 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Pou3f1P21952 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Pou3f1P21952 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Pou3f1P21952 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Pou3f1P21952 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Pou3f1P21952 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Pou3f1P21952 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Pou3f1P21952 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Pou3f1P21952 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Pou3f1P21952 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Pou3f1P21952 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Pou3f1P21952 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Pou3f1P21952 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Pou3f1P21952 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Pou3f1P21952 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Pou3f1P21952 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Pou3f1P21952 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Pou3f1P21952 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Pou3f1P21952 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Pou3f1P21952 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Pou3f1P21952 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Pou3f1P21952 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Pou3f1P21952 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Pou3f1P21952 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Pou3f1P21952 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Pou3f1P21952 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Pou3f1P21952 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Pou3f1P21952 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Pou3f1P21952 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Pou3f1P21952 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Pou3f1P21952 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Pou3f1P21952 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Pou3f1P21952 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Pou3f1P21952 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Pou3f1P21952 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Pou3f1P21952 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Pou3f1P21952 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Pou3f1P21952 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Pou3f1P21952 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Pou3f1P21952 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Pou3f1P21952 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Pou3f1P21952 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Pou3f1P21952 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Pou3f1P21952 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Pou3f1P21952 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Pou3f1P21952 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Pou3f1P21952 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Pou3f1P21952 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
Pou3f1P21952 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Pou3f1P21952 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Pou3f1P21952 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Pou3f1P21952 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Pou3f1P21952 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Pou3f1P21952 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Pou3f1P21952 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Pou3f1P21952 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Pou3f1P21952 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Pou3f1P21952 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Pou3f1P21952 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Pou3f1P21952 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Pou3f1P21952 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Pou3f1P21952 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
Pou3f1P21952 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Pou3f1P21952 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Pou3f1P21952 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Pou3f1P21952 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Pou3f1P21952 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Pou3f1P21952 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Pou3f1P21952 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Pou3f1P21952 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Pou3f1P21952 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Pou3f1P21952 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Pou3f1P21952 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Pou3f1P21952 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Pou3f1P21952 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
Pou3f1P21952 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Pou3f1P21952 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Pou3f1P21952 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Pou3f1P21952 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Pou3f1P21952 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Pou3f1P21952 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Pou3f1P21952 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Pou3f1P21952 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Pou3f1P21952 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Pou3f1P21952 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Pou3f1P21952 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC20.89■□□□□ 0.94
Pou3f1P21952 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC20.89■□□□□ 0.94
Pou3f1P21952 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC20.89■□□□□ 0.94
Pou3f1P21952 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Pou3f1P21952 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Pou3f1P21952 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Pou3f1P21952 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Pou3f1P21952 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Pou3f1P21952 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Pou3f1P21952 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Pou3f1P21952 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Pou3f1P21952 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 92.9 ms