Protein–RNA interactions for Protein: P21675

TAF1, Transcription initiation factor TFIID subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,872 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF1P21675 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.78■■■□□ 2.68
TAF1P21675 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.78■■■□□ 2.68
TAF1P21675 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.78■■■□□ 2.68
TAF1P21675 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.77■■■□□ 2.68
TAF1P21675 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.77■■■□□ 2.68
TAF1P21675 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.77■■■□□ 2.68
TAF1P21675 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC31.77■■■□□ 2.68
TAF1P21675 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.76■■■□□ 2.68
TAF1P21675 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
TAF1P21675 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.75■■■□□ 2.67
TAF1P21675 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC31.75■■■□□ 2.67
TAF1P21675 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.74■■■□□ 2.67
TAF1P21675 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC31.74■■■□□ 2.67
TAF1P21675 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.74■■■□□ 2.67
TAF1P21675 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.73■■■□□ 2.67
TAF1P21675 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC31.72■■■□□ 2.67
TAF1P21675 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC31.72■■■□□ 2.67
TAF1P21675 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC31.72■■■□□ 2.67
TAF1P21675 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC31.72■■■□□ 2.67
TAF1P21675 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC31.72■■■□□ 2.67
TAF1P21675 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
TAF1P21675 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.67
TAF1P21675 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC31.7■■■□□ 2.67
TAF1P21675 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.67
TAF1P21675 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.66
TAF1P21675 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.66
TAF1P21675 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC31.69■■■□□ 2.66
TAF1P21675 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC31.68■■■□□ 2.66
TAF1P21675 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC31.68■■■□□ 2.66
TAF1P21675 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC31.68■■■□□ 2.66
TAF1P21675 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC31.68■■■□□ 2.66
TAF1P21675 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC31.66■■■□□ 2.66
TAF1P21675 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC31.66■■■□□ 2.66
TAF1P21675 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC31.66■■■□□ 2.66
TAF1P21675 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC31.66■■■□□ 2.66
TAF1P21675 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
TAF1P21675 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
TAF1P21675 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC31.64■■■□□ 2.66
TAF1P21675 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
TAF1P21675 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC31.64■■■□□ 2.66
TAF1P21675 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.65
TAF1P21675 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
TAF1P21675 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
TAF1P21675 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC31.63■■■□□ 2.65
TAF1P21675 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
TAF1P21675 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
TAF1P21675 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
TAF1P21675 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC31.62■■■□□ 2.65
TAF1P21675 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
TAF1P21675 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
TAF1P21675 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC31.62■■■□□ 2.65
TAF1P21675 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC31.61■■■□□ 2.65
TAF1P21675 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
TAF1P21675 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC31.61■■■□□ 2.65
TAF1P21675 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
TAF1P21675 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC31.61■■■□□ 2.65
TAF1P21675 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
TAF1P21675 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC31.59■■■□□ 2.65
TAF1P21675 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
TAF1P21675 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
TAF1P21675 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC31.59■■■□□ 2.65
TAF1P21675 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC31.59■■■□□ 2.65
TAF1P21675 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
TAF1P21675 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC31.58■■■□□ 2.65
TAF1P21675 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
TAF1P21675 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC31.57■■■□□ 2.64
TAF1P21675 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
TAF1P21675 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC31.56■■■□□ 2.64
TAF1P21675 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC31.55■■■□□ 2.64
TAF1P21675 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC31.55■■■□□ 2.64
TAF1P21675 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
TAF1P21675 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
TAF1P21675 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC31.54■■■□□ 2.64
TAF1P21675 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC31.54■■■□□ 2.64
TAF1P21675 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC31.54■■■□□ 2.64
TAF1P21675 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
TAF1P21675 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
TAF1P21675 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
TAF1P21675 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.63
TAF1P21675 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC31.51■■■□□ 2.63
TAF1P21675 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC31.5■■■□□ 2.63
TAF1P21675 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
TAF1P21675 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
TAF1P21675 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.48■■■□□ 2.63
TAF1P21675 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
TAF1P21675 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
TAF1P21675 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
TAF1P21675 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
TAF1P21675 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
TAF1P21675 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
TAF1P21675 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.63
TAF1P21675 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.63
TAF1P21675 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.45■■■□□ 2.62
TAF1P21675 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
TAF1P21675 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
TAF1P21675 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
TAF1P21675 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC31.43■■■□□ 2.62
TAF1P21675 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC31.43■■■□□ 2.62
TAF1P21675 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
TAF1P21675 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.1 ms