Protein–RNA interactions for Protein: P21439

ABCB4, Phosphatidylcholine translocator ABCB4, humanhuman

Predictions only

Length 1,286 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCB4P21439 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
ABCB4P21439 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC27.11■■□□□ 1.93
ABCB4P21439 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
ABCB4P21439 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC27.11■■□□□ 1.93
ABCB4P21439 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
ABCB4P21439 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
ABCB4P21439 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
ABCB4P21439 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC27.1■■□□□ 1.93
ABCB4P21439 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
ABCB4P21439 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
ABCB4P21439 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
ABCB4P21439 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
ABCB4P21439 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
ABCB4P21439 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
ABCB4P21439 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
ABCB4P21439 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC27.08■■□□□ 1.93
ABCB4P21439 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC27.08■■□□□ 1.93
ABCB4P21439 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
ABCB4P21439 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
ABCB4P21439 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
ABCB4P21439 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
ABCB4P21439 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
ABCB4P21439 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
ABCB4P21439 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
ABCB4P21439 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
ABCB4P21439 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
ABCB4P21439 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
ABCB4P21439 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
ABCB4P21439 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
ABCB4P21439 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
ABCB4P21439 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
ABCB4P21439 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC27.06■■□□□ 1.92
ABCB4P21439 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
ABCB4P21439 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
ABCB4P21439 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
ABCB4P21439 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
ABCB4P21439 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
ABCB4P21439 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
ABCB4P21439 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
ABCB4P21439 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
ABCB4P21439 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
ABCB4P21439 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
ABCB4P21439 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
ABCB4P21439 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC27.05■■□□□ 1.92
ABCB4P21439 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
ABCB4P21439 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
ABCB4P21439 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
ABCB4P21439 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
ABCB4P21439 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
ABCB4P21439 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
ABCB4P21439 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
ABCB4P21439 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
ABCB4P21439 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
ABCB4P21439 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
ABCB4P21439 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
ABCB4P21439 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
ABCB4P21439 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
ABCB4P21439 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
ABCB4P21439 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
ABCB4P21439 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
ABCB4P21439 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
ABCB4P21439 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
ABCB4P21439 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
ABCB4P21439 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC27■■□□□ 1.91
ABCB4P21439 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
ABCB4P21439 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
ABCB4P21439 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
ABCB4P21439 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
ABCB4P21439 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC26.98■■□□□ 1.91
ABCB4P21439 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
ABCB4P21439 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
ABCB4P21439 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
ABCB4P21439 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC26.97■■□□□ 1.91
ABCB4P21439 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
ABCB4P21439 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
ABCB4P21439 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
ABCB4P21439 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
ABCB4P21439 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
ABCB4P21439 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
ABCB4P21439 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
ABCB4P21439 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
ABCB4P21439 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
ABCB4P21439 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
ABCB4P21439 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
ABCB4P21439 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
ABCB4P21439 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
ABCB4P21439 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC26.95■■□□□ 1.91
ABCB4P21439 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
ABCB4P21439 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
ABCB4P21439 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
ABCB4P21439 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
ABCB4P21439 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
ABCB4P21439 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
ABCB4P21439 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
ABCB4P21439 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC26.94■■□□□ 1.9
ABCB4P21439 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
ABCB4P21439 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC26.93■■□□□ 1.9
ABCB4P21439 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
ABCB4P21439 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
ABCB4P21439 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23 ms