Protein–RNA interactions for Protein: P21107

Tpm3, Tropomyosin alpha-3 chain, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 285 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tpm3P21107 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Tpm3P21107 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Tpm3P21107 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Tpm3P21107 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Tpm3P21107 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Tpm3P21107 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
Tpm3P21107 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
Tpm3P21107 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Tpm3P21107 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Tpm3P21107 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Tpm3P21107 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Tpm3P21107 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Tpm3P21107 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Tpm3P21107 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Tpm3P21107 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Tpm3P21107 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Tpm3P21107 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Tpm3P21107 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Tpm3P21107 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Tpm3P21107 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Tpm3P21107 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Tpm3P21107 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Tpm3P21107 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Tpm3P21107 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.75
Tpm3P21107 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
Tpm3P21107 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Tpm3P21107 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Tpm3P21107 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Tpm3P21107 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Tpm3P21107 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Tpm3P21107 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Tpm3P21107 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Tpm3P21107 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Tpm3P21107 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Tpm3P21107 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Tpm3P21107 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Tpm3P21107 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Tpm3P21107 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Tpm3P21107 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Tpm3P21107 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Tpm3P21107 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Tpm3P21107 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Tpm3P21107 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
Tpm3P21107 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Tpm3P21107 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Tpm3P21107 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Tpm3P21107 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Tpm3P21107 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Tpm3P21107 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Tpm3P21107 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Tpm3P21107 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Tpm3P21107 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Tpm3P21107 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Tpm3P21107 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Tpm3P21107 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Tpm3P21107 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Tpm3P21107 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Tpm3P21107 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Tpm3P21107 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Tpm3P21107 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Tpm3P21107 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Tpm3P21107 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Tpm3P21107 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Tpm3P21107 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Tpm3P21107 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Tpm3P21107 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Tpm3P21107 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Tpm3P21107 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Tpm3P21107 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Tpm3P21107 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Tpm3P21107 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Tpm3P21107 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Tpm3P21107 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Tpm3P21107 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Tpm3P21107 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Tpm3P21107 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Tpm3P21107 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Tpm3P21107 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Tpm3P21107 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Tpm3P21107 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Tpm3P21107 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Tpm3P21107 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Tpm3P21107 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Tpm3P21107 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Tpm3P21107 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Tpm3P21107 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Tpm3P21107 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Tpm3P21107 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Tpm3P21107 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Tpm3P21107 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Tpm3P21107 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Tpm3P21107 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Tpm3P21107 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Tpm3P21107 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Tpm3P21107 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Tpm3P21107 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Tpm3P21107 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Tpm3P21107 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Tpm3P21107 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Tpm3P21107 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.4 ms