Protein–RNA interactions for Protein: P20941

PDC, Phosducin, humanhuman

Predictions only

Length 246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCP20941 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC29.58■■■□□ 2.33
PDCP20941 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC29.58■■■□□ 2.33
PDCP20941 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.57■■■□□ 2.32
PDCP20941 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
PDCP20941 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC29.57■■■□□ 2.32
PDCP20941 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
PDCP20941 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
PDCP20941 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
PDCP20941 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
PDCP20941 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
PDCP20941 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
PDCP20941 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
PDCP20941 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
PDCP20941 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
PDCP20941 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
PDCP20941 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
PDCP20941 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
PDCP20941 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
PDCP20941 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC29.51■■■□□ 2.31
PDCP20941 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC29.51■■■□□ 2.31
PDCP20941 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC29.51■■■□□ 2.31
PDCP20941 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
PDCP20941 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
PDCP20941 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
PDCP20941 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
PDCP20941 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC29.5■■■□□ 2.31
PDCP20941 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
PDCP20941 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
PDCP20941 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC29.49■■■□□ 2.31
PDCP20941 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
PDCP20941 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
PDCP20941 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC29.48■■■□□ 2.31
PDCP20941 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
PDCP20941 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
PDCP20941 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC29.47■■■□□ 2.31
PDCP20941 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC29.47■■■□□ 2.31
PDCP20941 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
PDCP20941 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
PDCP20941 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC29.46■■■□□ 2.31
PDCP20941 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.46■■■□□ 2.31
PDCP20941 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
PDCP20941 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC29.45■■■□□ 2.31
PDCP20941 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.31
PDCP20941 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
PDCP20941 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC29.44■■■□□ 2.3
PDCP20941 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC29.43■■■□□ 2.3
PDCP20941 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
PDCP20941 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC29.43■■■□□ 2.3
PDCP20941 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
PDCP20941 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
PDCP20941 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
PDCP20941 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
PDCP20941 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
PDCP20941 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
PDCP20941 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
PDCP20941 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC29.4■■■□□ 2.3
PDCP20941 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
PDCP20941 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.3
PDCP20941 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
PDCP20941 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC29.39■■■□□ 2.29
PDCP20941 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
PDCP20941 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
PDCP20941 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
PDCP20941 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
PDCP20941 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC29.37■■■□□ 2.29
PDCP20941 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC29.37■■■□□ 2.29
PDCP20941 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
PDCP20941 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
PDCP20941 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
PDCP20941 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
PDCP20941 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
PDCP20941 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC29.35■■■□□ 2.29
PDCP20941 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
PDCP20941 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
PDCP20941 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
PDCP20941 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
PDCP20941 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
PDCP20941 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC29.33■■■□□ 2.29
PDCP20941 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
PDCP20941 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
PDCP20941 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
PDCP20941 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
PDCP20941 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
PDCP20941 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
PDCP20941 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
PDCP20941 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
PDCP20941 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC29.3■■■□□ 2.28
PDCP20941 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
PDCP20941 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
PDCP20941 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
PDCP20941 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
PDCP20941 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
PDCP20941 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC29.28■■■□□ 2.28
PDCP20941 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
PDCP20941 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
PDCP20941 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
PDCP20941 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
PDCP20941 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
PDCP20941 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC29.27■■■□□ 2.28
PDCP20941 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.8 ms