Protein–RNA interactions for Protein: P20664

Prim1, DNA primase small subunit, mousemouse

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prim1P20664 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
Prim1P20664 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC30.03■■■□□ 2.4
Prim1P20664 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC30.03■■■□□ 2.4
Prim1P20664 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
Prim1P20664 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
Prim1P20664 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC30.02■■■□□ 2.4
Prim1P20664 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC30.02■■■□□ 2.4
Prim1P20664 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
Prim1P20664 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC30.02■■■□□ 2.4
Prim1P20664 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC30.02■■■□□ 2.4
Prim1P20664 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
Prim1P20664 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC30■■■□□ 2.39
Prim1P20664 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
Prim1P20664 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
Prim1P20664 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
Prim1P20664 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
Prim1P20664 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
Prim1P20664 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
Prim1P20664 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC29.98■■■□□ 2.39
Prim1P20664 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
Prim1P20664 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC29.98■■■□□ 2.39
Prim1P20664 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
Prim1P20664 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
Prim1P20664 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
Prim1P20664 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
Prim1P20664 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
Prim1P20664 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
Prim1P20664 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC29.96■■■□□ 2.39
Prim1P20664 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC29.94■■■□□ 2.38
Prim1P20664 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC29.93■■■□□ 2.38
Prim1P20664 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC29.93■■■□□ 2.38
Prim1P20664 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC29.92■■■□□ 2.38
Prim1P20664 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC29.92■■■□□ 2.38
Prim1P20664 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC29.92■■■□□ 2.38
Prim1P20664 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
Prim1P20664 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
Prim1P20664 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
Prim1P20664 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC29.91■■■□□ 2.38
Prim1P20664 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
Prim1P20664 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
Prim1P20664 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
Prim1P20664 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
Prim1P20664 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
Prim1P20664 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
Prim1P20664 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC29.88■■■□□ 2.37
Prim1P20664 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC29.88■■■□□ 2.37
Prim1P20664 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
Prim1P20664 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.87■■■□□ 2.37
Prim1P20664 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
Prim1P20664 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
Prim1P20664 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
Prim1P20664 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
Prim1P20664 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
Prim1P20664 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC29.85■■■□□ 2.37
Prim1P20664 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
Prim1P20664 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
Prim1P20664 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
Prim1P20664 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
Prim1P20664 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC29.83■■■□□ 2.37
Prim1P20664 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
Prim1P20664 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
Prim1P20664 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC29.83■■■□□ 2.37
Prim1P20664 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
Prim1P20664 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.37
Prim1P20664 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
Prim1P20664 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
Prim1P20664 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
Prim1P20664 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC29.81■■■□□ 2.36
Prim1P20664 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
Prim1P20664 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
Prim1P20664 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
Prim1P20664 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC29.8■■■□□ 2.36
Prim1P20664 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC29.79■■■□□ 2.36
Prim1P20664 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
Prim1P20664 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
Prim1P20664 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
Prim1P20664 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
Prim1P20664 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
Prim1P20664 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
Prim1P20664 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.36
Prim1P20664 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.36
Prim1P20664 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.76■■■□□ 2.35
Prim1P20664 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
Prim1P20664 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC29.75■■■□□ 2.35
Prim1P20664 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
Prim1P20664 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC29.74■■■□□ 2.35
Prim1P20664 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
Prim1P20664 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC29.74■■■□□ 2.35
Prim1P20664 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
Prim1P20664 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
Prim1P20664 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
Prim1P20664 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
Prim1P20664 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
Prim1P20664 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
Prim1P20664 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
Prim1P20664 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC29.72■■■□□ 2.35
Prim1P20664 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.72■■■□□ 2.35
Prim1P20664 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.72■■■□□ 2.35
Prim1P20664 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
Prim1P20664 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.71■■■□□ 2.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.2 ms