Protein–RNA interactions for Protein: P20132

SDS, L-serine dehydratase/L-threonine deaminase, humanhuman

Predictions only

Length 328 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SDSP20132 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC31.06■■■□□ 2.56
SDSP20132 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC31.06■■■□□ 2.56
SDSP20132 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
SDSP20132 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC31.06■■■□□ 2.56
SDSP20132 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC31.06■■■□□ 2.56
SDSP20132 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
SDSP20132 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
SDSP20132 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
SDSP20132 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
SDSP20132 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC31.05■■■□□ 2.56
SDSP20132 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC31.05■■■□□ 2.56
SDSP20132 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
SDSP20132 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
SDSP20132 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.05■■■□□ 2.56
SDSP20132 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.04■■■□□ 2.56
SDSP20132 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
SDSP20132 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
SDSP20132 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.04■■■□□ 2.56
SDSP20132 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
SDSP20132 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
SDSP20132 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
SDSP20132 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC31.03■■■□□ 2.56
SDSP20132 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
SDSP20132 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC31.03■■■□□ 2.56
SDSP20132 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
SDSP20132 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
SDSP20132 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
SDSP20132 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.56
SDSP20132 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC31.01■■■□□ 2.55
SDSP20132 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
SDSP20132 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
SDSP20132 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC30.99■■■□□ 2.55
SDSP20132 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.99■■■□□ 2.55
SDSP20132 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC30.99■■■□□ 2.55
SDSP20132 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC30.99■■■□□ 2.55
SDSP20132 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
SDSP20132 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC30.98■■■□□ 2.55
SDSP20132 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
SDSP20132 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC30.97■■■□□ 2.55
SDSP20132 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
SDSP20132 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
SDSP20132 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
SDSP20132 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.96■■■□□ 2.55
SDSP20132 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC30.95■■■□□ 2.55
SDSP20132 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC30.95■■■□□ 2.55
SDSP20132 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.54
SDSP20132 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
SDSP20132 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC30.94■■■□□ 2.54
SDSP20132 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.94■■■□□ 2.54
SDSP20132 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.94■■■□□ 2.54
SDSP20132 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC30.94■■■□□ 2.54
SDSP20132 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC30.94■■■□□ 2.54
SDSP20132 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
SDSP20132 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC30.93■■■□□ 2.54
SDSP20132 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
SDSP20132 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC30.92■■■□□ 2.54
SDSP20132 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC30.92■■■□□ 2.54
SDSP20132 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
SDSP20132 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC30.92■■■□□ 2.54
SDSP20132 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC30.92■■■□□ 2.54
SDSP20132 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
SDSP20132 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
SDSP20132 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
SDSP20132 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
SDSP20132 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
SDSP20132 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC30.89■■■□□ 2.54
SDSP20132 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC30.89■■■□□ 2.54
SDSP20132 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.89■■■□□ 2.53
SDSP20132 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.88■■■□□ 2.53
SDSP20132 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
SDSP20132 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
SDSP20132 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC30.87■■■□□ 2.53
SDSP20132 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
SDSP20132 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
SDSP20132 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
SDSP20132 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.86■■■□□ 2.53
SDSP20132 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC30.86■■■□□ 2.53
SDSP20132 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC30.85■■■□□ 2.53
SDSP20132 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.85■■■□□ 2.53
SDSP20132 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
SDSP20132 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC30.85■■■□□ 2.53
SDSP20132 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC30.85■■■□□ 2.53
SDSP20132 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.85■■■□□ 2.53
SDSP20132 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
SDSP20132 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
SDSP20132 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
SDSP20132 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
SDSP20132 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
SDSP20132 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.83■■■□□ 2.53
SDSP20132 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC30.83■■■□□ 2.53
SDSP20132 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
SDSP20132 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
SDSP20132 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
SDSP20132 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC30.82■■■□□ 2.52
SDSP20132 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
SDSP20132 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC30.82■■■□□ 2.52
SDSP20132 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC30.82■■■□□ 2.52
SDSP20132 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
SDSP20132 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC30.81■■■□□ 2.52
SDSP20132 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.7 ms