Protein–RNA interactions for Protein: P19437

Ms4a1, B-lymphocyte antigen CD20, mousemouse

Predictions only

Length 291 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ms4a1P19437 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Ms4a1P19437 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Ms4a1P19437 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Ms4a1P19437 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Ms4a1P19437 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Ms4a1P19437 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Ms4a1P19437 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Ms4a1P19437 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Ms4a1P19437 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Ms4a1P19437 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Ms4a1P19437 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Ms4a1P19437 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Ms4a1P19437 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Ms4a1P19437 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Ms4a1P19437 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Ms4a1P19437 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Ms4a1P19437 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Ms4a1P19437 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Ms4a1P19437 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Ms4a1P19437 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Ms4a1P19437 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Ms4a1P19437 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Ms4a1P19437 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Ms4a1P19437 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Ms4a1P19437 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Ms4a1P19437 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Ms4a1P19437 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Ms4a1P19437 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Ms4a1P19437 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Ms4a1P19437 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Ms4a1P19437 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Ms4a1P19437 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Ms4a1P19437 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Ms4a1P19437 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Ms4a1P19437 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Ms4a1P19437 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Ms4a1P19437 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Ms4a1P19437 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Ms4a1P19437 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Ms4a1P19437 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Ms4a1P19437 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Ms4a1P19437 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Ms4a1P19437 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
Ms4a1P19437 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Ms4a1P19437 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Ms4a1P19437 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Ms4a1P19437 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Ms4a1P19437 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Ms4a1P19437 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Ms4a1P19437 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Ms4a1P19437 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Ms4a1P19437 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Ms4a1P19437 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Ms4a1P19437 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Ms4a1P19437 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Ms4a1P19437 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Ms4a1P19437 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Ms4a1P19437 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Ms4a1P19437 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Ms4a1P19437 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Ms4a1P19437 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Ms4a1P19437 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
Ms4a1P19437 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Ms4a1P19437 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Ms4a1P19437 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Ms4a1P19437 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Ms4a1P19437 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Ms4a1P19437 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Ms4a1P19437 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Ms4a1P19437 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Ms4a1P19437 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Ms4a1P19437 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Ms4a1P19437 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Ms4a1P19437 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Ms4a1P19437 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Ms4a1P19437 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Ms4a1P19437 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Ms4a1P19437 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Ms4a1P19437 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Ms4a1P19437 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Ms4a1P19437 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Ms4a1P19437 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Ms4a1P19437 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Ms4a1P19437 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Ms4a1P19437 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
Ms4a1P19437 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Ms4a1P19437 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Ms4a1P19437 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Ms4a1P19437 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Ms4a1P19437 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Ms4a1P19437 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Ms4a1P19437 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Ms4a1P19437 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Ms4a1P19437 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Ms4a1P19437 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
Ms4a1P19437 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Ms4a1P19437 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Ms4a1P19437 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Ms4a1P19437 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Ms4a1P19437 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.1 ms