Protein–RNA interactions for Protein: P19387

POLR2C, DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 275 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2CP19387 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
POLR2CP19387 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
POLR2CP19387 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
POLR2CP19387 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
POLR2CP19387 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
POLR2CP19387 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
POLR2CP19387 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
POLR2CP19387 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
POLR2CP19387 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
POLR2CP19387 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
POLR2CP19387 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
POLR2CP19387 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
POLR2CP19387 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
POLR2CP19387 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
POLR2CP19387 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
POLR2CP19387 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
POLR2CP19387 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
POLR2CP19387 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
POLR2CP19387 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
POLR2CP19387 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
POLR2CP19387 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
POLR2CP19387 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
POLR2CP19387 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
POLR2CP19387 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
POLR2CP19387 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
POLR2CP19387 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
POLR2CP19387 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
POLR2CP19387 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
POLR2CP19387 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
POLR2CP19387 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
POLR2CP19387 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
POLR2CP19387 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
POLR2CP19387 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
POLR2CP19387 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
POLR2CP19387 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
POLR2CP19387 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
POLR2CP19387 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
POLR2CP19387 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
POLR2CP19387 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
POLR2CP19387 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
POLR2CP19387 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
POLR2CP19387 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
POLR2CP19387 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
POLR2CP19387 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
POLR2CP19387 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
POLR2CP19387 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
POLR2CP19387 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
POLR2CP19387 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
POLR2CP19387 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
POLR2CP19387 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
POLR2CP19387 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
POLR2CP19387 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
POLR2CP19387 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
POLR2CP19387 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
POLR2CP19387 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
POLR2CP19387 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
POLR2CP19387 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
POLR2CP19387 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
POLR2CP19387 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
POLR2CP19387 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
POLR2CP19387 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
POLR2CP19387 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
POLR2CP19387 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
POLR2CP19387 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
POLR2CP19387 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
POLR2CP19387 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
POLR2CP19387 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
POLR2CP19387 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
POLR2CP19387 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
POLR2CP19387 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
POLR2CP19387 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
POLR2CP19387 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
POLR2CP19387 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
POLR2CP19387 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
POLR2CP19387 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
POLR2CP19387 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
POLR2CP19387 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
POLR2CP19387 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
POLR2CP19387 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
POLR2CP19387 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
POLR2CP19387 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
POLR2CP19387 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
POLR2CP19387 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
POLR2CP19387 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
POLR2CP19387 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
POLR2CP19387 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
POLR2CP19387 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
POLR2CP19387 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
POLR2CP19387 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
POLR2CP19387 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
POLR2CP19387 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
POLR2CP19387 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
POLR2CP19387 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
POLR2CP19387 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
POLR2CP19387 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
POLR2CP19387 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
POLR2CP19387 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
POLR2CP19387 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
POLR2CP19387 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
POLR2CP19387 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66 ms