Protein–RNA interactions for Protein: P19022

CDH2, Cadherin-2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 906 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH2P19022 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CDH2P19022 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
CDH2P19022 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
CDH2P19022 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.4
CDH2P19022 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CDH2P19022 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CDH2P19022 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CDH2P19022 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CDH2P19022 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CDH2P19022 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CDH2P19022 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CDH2P19022 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CDH2P19022 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CDH2P19022 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CDH2P19022 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CDH2P19022 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CDH2P19022 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CDH2P19022 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CDH2P19022 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CDH2P19022 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CDH2P19022 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CDH2P19022 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CDH2P19022 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CDH2P19022 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CDH2P19022 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CDH2P19022 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CDH2P19022 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CDH2P19022 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
CDH2P19022 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CDH2P19022 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CDH2P19022 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CDH2P19022 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CDH2P19022 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CDH2P19022 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CDH2P19022 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CDH2P19022 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CDH2P19022 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CDH2P19022 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CDH2P19022 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CDH2P19022 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CDH2P19022 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CDH2P19022 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CDH2P19022 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CDH2P19022 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CDH2P19022 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CDH2P19022 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CDH2P19022 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CDH2P19022 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CDH2P19022 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CDH2P19022 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CDH2P19022 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CDH2P19022 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CDH2P19022 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CDH2P19022 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CDH2P19022 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CDH2P19022 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CDH2P19022 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CDH2P19022 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CDH2P19022 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CDH2P19022 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CDH2P19022 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CDH2P19022 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
CDH2P19022 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CDH2P19022 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CDH2P19022 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CDH2P19022 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CDH2P19022 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CDH2P19022 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CDH2P19022 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CDH2P19022 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CDH2P19022 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CDH2P19022 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CDH2P19022 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CDH2P19022 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CDH2P19022 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CDH2P19022 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
CDH2P19022 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CDH2P19022 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CDH2P19022 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
CDH2P19022 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
CDH2P19022 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
CDH2P19022 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CDH2P19022 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CDH2P19022 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CDH2P19022 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CDH2P19022 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CDH2P19022 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CDH2P19022 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CDH2P19022 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CDH2P19022 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CDH2P19022 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CDH2P19022 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CDH2P19022 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CDH2P19022 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CDH2P19022 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CDH2P19022 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CDH2P19022 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CDH2P19022 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CDH2P19022 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CDH2P19022 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.2 ms