Protein–RNA interactions for Protein: P19012

KRT15, Keratin, type I cytoskeletal 15, humanhuman

Predictions only

Length 456 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT15P19012 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
KRT15P19012 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
KRT15P19012 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
KRT15P19012 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
KRT15P19012 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
KRT15P19012 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
KRT15P19012 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
KRT15P19012 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
KRT15P19012 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
KRT15P19012 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
KRT15P19012 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
KRT15P19012 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC25.57■■□□□ 1.68
KRT15P19012 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
KRT15P19012 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
KRT15P19012 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
KRT15P19012 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
KRT15P19012 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
KRT15P19012 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
KRT15P19012 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
KRT15P19012 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
KRT15P19012 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
KRT15P19012 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
KRT15P19012 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
KRT15P19012 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
KRT15P19012 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
KRT15P19012 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
KRT15P19012 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
KRT15P19012 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
KRT15P19012 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
KRT15P19012 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
KRT15P19012 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
KRT15P19012 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
KRT15P19012 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
KRT15P19012 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
KRT15P19012 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
KRT15P19012 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
KRT15P19012 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
KRT15P19012 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC25.48■■□□□ 1.67
KRT15P19012 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
KRT15P19012 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC25.48■■□□□ 1.67
KRT15P19012 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
KRT15P19012 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
KRT15P19012 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
KRT15P19012 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
KRT15P19012 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
KRT15P19012 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
KRT15P19012 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
KRT15P19012 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
KRT15P19012 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
KRT15P19012 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
KRT15P19012 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
KRT15P19012 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
KRT15P19012 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
KRT15P19012 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
KRT15P19012 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
KRT15P19012 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
KRT15P19012 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
KRT15P19012 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
KRT15P19012 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
KRT15P19012 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
KRT15P19012 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
KRT15P19012 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC25.41■■□□□ 1.66
KRT15P19012 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
KRT15P19012 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
KRT15P19012 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
KRT15P19012 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
KRT15P19012 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
KRT15P19012 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
KRT15P19012 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
KRT15P19012 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
KRT15P19012 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
KRT15P19012 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
KRT15P19012 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
KRT15P19012 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
KRT15P19012 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
KRT15P19012 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC25.39■■□□□ 1.65
KRT15P19012 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
KRT15P19012 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
KRT15P19012 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC25.38■■□□□ 1.65
KRT15P19012 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
KRT15P19012 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
KRT15P19012 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
KRT15P19012 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
KRT15P19012 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
KRT15P19012 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
KRT15P19012 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
KRT15P19012 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
KRT15P19012 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
KRT15P19012 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
KRT15P19012 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
KRT15P19012 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
KRT15P19012 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
KRT15P19012 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
KRT15P19012 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
KRT15P19012 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
KRT15P19012 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
KRT15P19012 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
KRT15P19012 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
KRT15P19012 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
KRT15P19012 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.5 ms