Protein–RNA interactions for Protein: P18654

Rps6ka3, Ribosomal protein S6 kinase alpha-3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 740 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps6ka3P18654 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rps6ka3P18654 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rps6ka3P18654 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rps6ka3P18654 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rps6ka3P18654 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rps6ka3P18654 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rps6ka3P18654 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rps6ka3P18654 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rps6ka3P18654 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rps6ka3P18654 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rps6ka3P18654 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rps6ka3P18654 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rps6ka3P18654 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rps6ka3P18654 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rps6ka3P18654 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rps6ka3P18654 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rps6ka3P18654 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rps6ka3P18654 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rps6ka3P18654 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rps6ka3P18654 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rps6ka3P18654 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rps6ka3P18654 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rps6ka3P18654 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Rps6ka3P18654 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Rps6ka3P18654 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Rps6ka3P18654 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Rps6ka3P18654 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Rps6ka3P18654 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Rps6ka3P18654 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Rps6ka3P18654 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Rps6ka3P18654 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Rps6ka3P18654 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC22■■□□□ 1.11
Rps6ka3P18654 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Rps6ka3P18654 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Rps6ka3P18654 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rps6ka3P18654 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rps6ka3P18654 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Rps6ka3P18654 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Rps6ka3P18654 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Rps6ka3P18654 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Rps6ka3P18654 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Rps6ka3P18654 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Rps6ka3P18654 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Rps6ka3P18654 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Rps6ka3P18654 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Rps6ka3P18654 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Rps6ka3P18654 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Rps6ka3P18654 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Rps6ka3P18654 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Rps6ka3P18654 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Rps6ka3P18654 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Rps6ka3P18654 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Rps6ka3P18654 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Rps6ka3P18654 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Rps6ka3P18654 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Rps6ka3P18654 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Rps6ka3P18654 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Rps6ka3P18654 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Rps6ka3P18654 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Rps6ka3P18654 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Rps6ka3P18654 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Rps6ka3P18654 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Rps6ka3P18654 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Rps6ka3P18654 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Rps6ka3P18654 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Rps6ka3P18654 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Rps6ka3P18654 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Rps6ka3P18654 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Rps6ka3P18654 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Rps6ka3P18654 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Rps6ka3P18654 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Rps6ka3P18654 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Rps6ka3P18654 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Rps6ka3P18654 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Rps6ka3P18654 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Rps6ka3P18654 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Rps6ka3P18654 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Rps6ka3P18654 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Rps6ka3P18654 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Rps6ka3P18654 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Rps6ka3P18654 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Rps6ka3P18654 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Rps6ka3P18654 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Rps6ka3P18654 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Rps6ka3P18654 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Rps6ka3P18654 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Rps6ka3P18654 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Rps6ka3P18654 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Rps6ka3P18654 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Rps6ka3P18654 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Rps6ka3P18654 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Rps6ka3P18654 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Rps6ka3P18654 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Rps6ka3P18654 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Rps6ka3P18654 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Rps6ka3P18654 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Rps6ka3P18654 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Rps6ka3P18654 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Rps6ka3P18654 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Rps6ka3P18654 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 124 ms