Protein–RNA interactions for Protein: P17987

TCP1, T-complex protein 1 subunit alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 556 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCP1P17987 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
TCP1P17987 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
TCP1P17987 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
TCP1P17987 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
TCP1P17987 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
TCP1P17987 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
TCP1P17987 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
TCP1P17987 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC26.74■■□□□ 1.87
TCP1P17987 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC26.74■■□□□ 1.87
TCP1P17987 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
TCP1P17987 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
TCP1P17987 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
TCP1P17987 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
TCP1P17987 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
TCP1P17987 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
TCP1P17987 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
TCP1P17987 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
TCP1P17987 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
TCP1P17987 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.87
TCP1P17987 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
TCP1P17987 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
TCP1P17987 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
TCP1P17987 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
TCP1P17987 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
TCP1P17987 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
TCP1P17987 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
TCP1P17987 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
TCP1P17987 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
TCP1P17987 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
TCP1P17987 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
TCP1P17987 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
TCP1P17987 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
TCP1P17987 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
TCP1P17987 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
TCP1P17987 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
TCP1P17987 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC26.65■■□□□ 1.86
TCP1P17987 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
TCP1P17987 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
TCP1P17987 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
TCP1P17987 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
TCP1P17987 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.85
TCP1P17987 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
TCP1P17987 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
TCP1P17987 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
TCP1P17987 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
TCP1P17987 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
TCP1P17987 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
TCP1P17987 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC26.62■■□□□ 1.85
TCP1P17987 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
TCP1P17987 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
TCP1P17987 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
TCP1P17987 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
TCP1P17987 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
TCP1P17987 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
TCP1P17987 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
TCP1P17987 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
TCP1P17987 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
TCP1P17987 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
TCP1P17987 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
TCP1P17987 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC26.59■■□□□ 1.85
TCP1P17987 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
TCP1P17987 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
TCP1P17987 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
TCP1P17987 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
TCP1P17987 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
TCP1P17987 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
TCP1P17987 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
TCP1P17987 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
TCP1P17987 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
TCP1P17987 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
TCP1P17987 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
TCP1P17987 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
TCP1P17987 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
TCP1P17987 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
TCP1P17987 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
TCP1P17987 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
TCP1P17987 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
TCP1P17987 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
TCP1P17987 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
TCP1P17987 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
TCP1P17987 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
TCP1P17987 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
TCP1P17987 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
TCP1P17987 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
TCP1P17987 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
TCP1P17987 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
TCP1P17987 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
TCP1P17987 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
TCP1P17987 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
TCP1P17987 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
TCP1P17987 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
TCP1P17987 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
TCP1P17987 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
TCP1P17987 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC26.51■■□□□ 1.83
TCP1P17987 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
TCP1P17987 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
TCP1P17987 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
TCP1P17987 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
TCP1P17987 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
TCP1P17987 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.9 ms