Protein–RNA interactions for Protein: P17679

Gata1, Erythroid transcription factor, mousemouse

Predictions only

Length 413 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gata1P17679 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gata1P17679 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gata1P17679 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gata1P17679 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gata1P17679 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Gata1P17679 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gata1P17679 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gata1P17679 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gata1P17679 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gata1P17679 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gata1P17679 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gata1P17679 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gata1P17679 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gata1P17679 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gata1P17679 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gata1P17679 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Gata1P17679 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gata1P17679 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gata1P17679 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gata1P17679 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gata1P17679 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gata1P17679 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gata1P17679 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gata1P17679 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gata1P17679 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gata1P17679 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gata1P17679 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gata1P17679 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gata1P17679 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gata1P17679 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gata1P17679 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gata1P17679 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gata1P17679 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gata1P17679 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gata1P17679 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gata1P17679 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gata1P17679 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gata1P17679 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gata1P17679 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gata1P17679 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gata1P17679 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gata1P17679 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gata1P17679 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gata1P17679 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gata1P17679 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gata1P17679 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gata1P17679 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gata1P17679 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gata1P17679 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gata1P17679 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gata1P17679 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gata1P17679 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gata1P17679 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gata1P17679 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gata1P17679 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gata1P17679 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gata1P17679 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gata1P17679 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gata1P17679 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gata1P17679 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gata1P17679 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Gata1P17679 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Gata1P17679 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gata1P17679 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gata1P17679 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gata1P17679 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gata1P17679 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gata1P17679 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gata1P17679 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gata1P17679 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gata1P17679 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gata1P17679 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gata1P17679 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gata1P17679 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gata1P17679 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gata1P17679 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gata1P17679 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gata1P17679 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Gata1P17679 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gata1P17679 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gata1P17679 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gata1P17679 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gata1P17679 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gata1P17679 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gata1P17679 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Gata1P17679 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Gata1P17679 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gata1P17679 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gata1P17679 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gata1P17679 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gata1P17679 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gata1P17679 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gata1P17679 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gata1P17679 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gata1P17679 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gata1P17679 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gata1P17679 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Gata1P17679 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gata1P17679 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gata1P17679 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 202 ms