Protein–RNA interactions for Protein: P17225

Ptbp1, Polypyrimidine tract-binding protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 527 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptbp1P17225 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ptbp1P17225 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ptbp1P17225 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ptbp1P17225 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ptbp1P17225 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ptbp1P17225 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ptbp1P17225 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ptbp1P17225 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ptbp1P17225 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ptbp1P17225 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ptbp1P17225 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ptbp1P17225 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ptbp1P17225 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ptbp1P17225 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ptbp1P17225 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ptbp1P17225 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ptbp1P17225 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ptbp1P17225 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ptbp1P17225 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ptbp1P17225 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Ptbp1P17225 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Ptbp1P17225 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ptbp1P17225 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ptbp1P17225 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ptbp1P17225 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ptbp1P17225 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Ptbp1P17225 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ptbp1P17225 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ptbp1P17225 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ptbp1P17225 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ptbp1P17225 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ptbp1P17225 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ptbp1P17225 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ptbp1P17225 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ptbp1P17225 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ptbp1P17225 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ptbp1P17225 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ptbp1P17225 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ptbp1P17225 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ptbp1P17225 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ptbp1P17225 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ptbp1P17225 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ptbp1P17225 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ptbp1P17225 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ptbp1P17225 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ptbp1P17225 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ptbp1P17225 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ptbp1P17225 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ptbp1P17225 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ptbp1P17225 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ptbp1P17225 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ptbp1P17225 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ptbp1P17225 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ptbp1P17225 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ptbp1P17225 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Ptbp1P17225 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ptbp1P17225 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ptbp1P17225 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ptbp1P17225 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ptbp1P17225 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Ptbp1P17225 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ptbp1P17225 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ptbp1P17225 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ptbp1P17225 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ptbp1P17225 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ptbp1P17225 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ptbp1P17225 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ptbp1P17225 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ptbp1P17225 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ptbp1P17225 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ptbp1P17225 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ptbp1P17225 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ptbp1P17225 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ptbp1P17225 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Ptbp1P17225 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ptbp1P17225 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Ptbp1P17225 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ptbp1P17225 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ptbp1P17225 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ptbp1P17225 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ptbp1P17225 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ptbp1P17225 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ptbp1P17225 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ptbp1P17225 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ptbp1P17225 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ptbp1P17225 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ptbp1P17225 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ptbp1P17225 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ptbp1P17225 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ptbp1P17225 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ptbp1P17225 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ptbp1P17225 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ptbp1P17225 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ptbp1P17225 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ptbp1P17225 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ptbp1P17225 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ptbp1P17225 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ptbp1P17225 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Ptbp1P17225 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ptbp1P17225 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.2 ms