Protein–RNA interactions for Protein: P16460

Ass1, Argininosuccinate synthase, mousemouse

Predictions only

Length 412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ass1P16460 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
Ass1P16460 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Ass1P16460 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
Ass1P16460 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Ass1P16460 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Ass1P16460 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Ass1P16460 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
Ass1P16460 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
Ass1P16460 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Ass1P16460 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Ass1P16460 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Ass1P16460 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Ass1P16460 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Ass1P16460 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Ass1P16460 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
Ass1P16460 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Ass1P16460 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Ass1P16460 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Ass1P16460 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Ass1P16460 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Ass1P16460 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Ass1P16460 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Ass1P16460 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Ass1P16460 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Ass1P16460 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Ass1P16460 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
Ass1P16460 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Ass1P16460 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Ass1P16460 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Ass1P16460 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Ass1P16460 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Ass1P16460 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Ass1P16460 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Ass1P16460 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Ass1P16460 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Ass1P16460 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Ass1P16460 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Ass1P16460 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Ass1P16460 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Ass1P16460 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
Ass1P16460 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Ass1P16460 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Ass1P16460 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Ass1P16460 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Ass1P16460 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Ass1P16460 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Ass1P16460 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Ass1P16460 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Ass1P16460 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
Ass1P16460 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Ass1P16460 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Ass1P16460 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Ass1P16460 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Ass1P16460 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
Ass1P16460 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
Ass1P16460 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ass1P16460 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ass1P16460 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ass1P16460 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ass1P16460 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ass1P16460 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ass1P16460 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Ass1P16460 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
Ass1P16460 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Ass1P16460 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Ass1P16460 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Ass1P16460 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Ass1P16460 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Ass1P16460 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Ass1P16460 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Ass1P16460 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Ass1P16460 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Ass1P16460 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Ass1P16460 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Ass1P16460 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Ass1P16460 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Ass1P16460 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Ass1P16460 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ass1P16460 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ass1P16460 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ass1P16460 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ass1P16460 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
Ass1P16460 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Ass1P16460 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Ass1P16460 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Ass1P16460 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Ass1P16460 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Ass1P16460 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Ass1P16460 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Ass1P16460 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
Ass1P16460 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Ass1P16460 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
Ass1P16460 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Ass1P16460 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ass1P16460 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
Ass1P16460 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Ass1P16460 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Ass1P16460 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
Ass1P16460 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
Ass1P16460 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.6 ms