Protein–RNA interactions for Protein: P16452

EPB42, Erythrocyte membrane protein band 4.2, humanhuman

Predictions only

Length 691 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPB42P16452 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
EPB42P16452 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
EPB42P16452 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
EPB42P16452 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC24.68■■□□□ 1.54
EPB42P16452 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
EPB42P16452 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
EPB42P16452 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
EPB42P16452 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
EPB42P16452 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
EPB42P16452 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
EPB42P16452 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC24.67■■□□□ 1.54
EPB42P16452 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
EPB42P16452 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
EPB42P16452 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
EPB42P16452 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
EPB42P16452 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
EPB42P16452 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
EPB42P16452 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
EPB42P16452 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
EPB42P16452 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
EPB42P16452 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
EPB42P16452 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
EPB42P16452 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
EPB42P16452 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
EPB42P16452 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
EPB42P16452 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
EPB42P16452 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
EPB42P16452 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
EPB42P16452 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
EPB42P16452 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
EPB42P16452 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
EPB42P16452 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
EPB42P16452 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
EPB42P16452 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
EPB42P16452 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
EPB42P16452 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
EPB42P16452 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
EPB42P16452 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
EPB42P16452 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
EPB42P16452 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
EPB42P16452 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
EPB42P16452 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
EPB42P16452 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
EPB42P16452 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
EPB42P16452 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
EPB42P16452 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
EPB42P16452 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
EPB42P16452 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
EPB42P16452 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
EPB42P16452 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
EPB42P16452 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
EPB42P16452 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
EPB42P16452 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
EPB42P16452 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
EPB42P16452 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
EPB42P16452 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
EPB42P16452 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
EPB42P16452 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
EPB42P16452 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
EPB42P16452 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
EPB42P16452 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
EPB42P16452 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
EPB42P16452 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
EPB42P16452 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
EPB42P16452 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
EPB42P16452 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
EPB42P16452 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
EPB42P16452 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
EPB42P16452 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
EPB42P16452 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
EPB42P16452 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
EPB42P16452 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
EPB42P16452 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
EPB42P16452 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
EPB42P16452 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
EPB42P16452 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
EPB42P16452 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
EPB42P16452 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
EPB42P16452 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
EPB42P16452 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
EPB42P16452 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
EPB42P16452 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
EPB42P16452 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
EPB42P16452 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
EPB42P16452 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
EPB42P16452 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
EPB42P16452 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
EPB42P16452 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
EPB42P16452 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
EPB42P16452 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
EPB42P16452 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
EPB42P16452 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
EPB42P16452 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
EPB42P16452 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
EPB42P16452 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
EPB42P16452 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
EPB42P16452 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
EPB42P16452 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
EPB42P16452 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
EPB42P16452 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.2 ms