Protein–RNA interactions for Protein: P15621

ZNF44, Zinc finger protein 44, humanhuman

Predictions only

Length 663 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF44P15621 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ZNF44P15621 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ZNF44P15621 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ZNF44P15621 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ZNF44P15621 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ZNF44P15621 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ZNF44P15621 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ZNF44P15621 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
ZNF44P15621 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ZNF44P15621 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ZNF44P15621 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ZNF44P15621 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ZNF44P15621 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ZNF44P15621 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ZNF44P15621 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ZNF44P15621 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
ZNF44P15621 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ZNF44P15621 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ZNF44P15621 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ZNF44P15621 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ZNF44P15621 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.03
ZNF44P15621 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ZNF44P15621 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ZNF44P15621 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
ZNF44P15621 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ZNF44P15621 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ZNF44P15621 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ZNF44P15621 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ZNF44P15621 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
ZNF44P15621 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ZNF44P15621 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ZNF44P15621 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ZNF44P15621 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ZNF44P15621 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ZNF44P15621 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ZNF44P15621 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ZNF44P15621 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ZNF44P15621 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
ZNF44P15621 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ZNF44P15621 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ZNF44P15621 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ZNF44P15621 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ZNF44P15621 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
ZNF44P15621 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
ZNF44P15621 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ZNF44P15621 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ZNF44P15621 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ZNF44P15621 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ZNF44P15621 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ZNF44P15621 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ZNF44P15621 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ZNF44P15621 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ZNF44P15621 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
ZNF44P15621 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ZNF44P15621 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ZNF44P15621 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ZNF44P15621 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ZNF44P15621 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ZNF44P15621 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ZNF44P15621 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ZNF44P15621 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ZNF44P15621 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ZNF44P15621 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ZNF44P15621 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ZNF44P15621 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ZNF44P15621 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
ZNF44P15621 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
ZNF44P15621 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ZNF44P15621 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ZNF44P15621 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ZNF44P15621 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ZNF44P15621 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ZNF44P15621 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ZNF44P15621 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ZNF44P15621 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ZNF44P15621 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ZNF44P15621 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ZNF44P15621 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ZNF44P15621 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ZNF44P15621 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ZNF44P15621 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ZNF44P15621 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ZNF44P15621 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ZNF44P15621 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ZNF44P15621 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ZNF44P15621 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ZNF44P15621 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1
ZNF44P15621 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
ZNF44P15621 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
ZNF44P15621 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
ZNF44P15621 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
ZNF44P15621 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
ZNF44P15621 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
ZNF44P15621 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC21.32■■□□□ 1
ZNF44P15621 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
ZNF44P15621 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
ZNF44P15621 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ZNF44P15621 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ZNF44P15621 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ZNF44P15621 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.6 ms