Protein–RNA interactions for Protein: P15532

Nme1, Nucleoside diphosphate kinase A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 152 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nme1P15532 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Nme1P15532 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Nme1P15532 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Nme1P15532 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Nme1P15532 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Nme1P15532 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Nme1P15532 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Nme1P15532 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Nme1P15532 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Nme1P15532 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Nme1P15532 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Nme1P15532 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Nme1P15532 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Nme1P15532 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Nme1P15532 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Nme1P15532 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Nme1P15532 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Nme1P15532 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Nme1P15532 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Nme1P15532 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Nme1P15532 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Nme1P15532 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Nme1P15532 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Nme1P15532 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Nme1P15532 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Nme1P15532 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Nme1P15532 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Nme1P15532 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Nme1P15532 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Nme1P15532 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Nme1P15532 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Nme1P15532 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Nme1P15532 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Nme1P15532 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Nme1P15532 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Nme1P15532 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Nme1P15532 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Nme1P15532 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Nme1P15532 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Nme1P15532 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Nme1P15532 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Nme1P15532 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Nme1P15532 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Nme1P15532 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Nme1P15532 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Nme1P15532 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Nme1P15532 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
Nme1P15532 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Nme1P15532 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Nme1P15532 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Nme1P15532 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Nme1P15532 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Nme1P15532 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Nme1P15532 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Nme1P15532 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Nme1P15532 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Nme1P15532 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Nme1P15532 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Nme1P15532 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Nme1P15532 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Nme1P15532 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Nme1P15532 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Nme1P15532 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Nme1P15532 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
Nme1P15532 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
Nme1P15532 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Nme1P15532 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Nme1P15532 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Nme1P15532 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Nme1P15532 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Nme1P15532 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Nme1P15532 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
Nme1P15532 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Nme1P15532 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Nme1P15532 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
Nme1P15532 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Nme1P15532 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Nme1P15532 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Nme1P15532 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Nme1P15532 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Nme1P15532 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Nme1P15532 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC21■□□□□ 0.95
Nme1P15532 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC21■□□□□ 0.95
Nme1P15532 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Nme1P15532 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Nme1P15532 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Nme1P15532 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Nme1P15532 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Nme1P15532 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Nme1P15532 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
Nme1P15532 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Nme1P15532 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Nme1P15532 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Nme1P15532 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Nme1P15532 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Nme1P15532 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Nme1P15532 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Nme1P15532 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
Nme1P15532 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Nme1P15532 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.1 ms