Protein–RNA interactions for Protein: P15172

MYOD1, Myoblast determination protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 320 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MYOD1P15172 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
MYOD1P15172 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
MYOD1P15172 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
MYOD1P15172 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
MYOD1P15172 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
MYOD1P15172 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
MYOD1P15172 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
MYOD1P15172 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
MYOD1P15172 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
MYOD1P15172 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
MYOD1P15172 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
MYOD1P15172 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
MYOD1P15172 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
MYOD1P15172 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
MYOD1P15172 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
MYOD1P15172 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
MYOD1P15172 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
MYOD1P15172 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
MYOD1P15172 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
MYOD1P15172 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
MYOD1P15172 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
MYOD1P15172 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
MYOD1P15172 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
MYOD1P15172 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
MYOD1P15172 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
MYOD1P15172 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
MYOD1P15172 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
MYOD1P15172 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
MYOD1P15172 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
MYOD1P15172 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
MYOD1P15172 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
MYOD1P15172 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
MYOD1P15172 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
MYOD1P15172 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
MYOD1P15172 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
MYOD1P15172 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
MYOD1P15172 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
MYOD1P15172 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
MYOD1P15172 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
MYOD1P15172 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
MYOD1P15172 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
MYOD1P15172 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
MYOD1P15172 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
MYOD1P15172 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
MYOD1P15172 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
MYOD1P15172 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
MYOD1P15172 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
MYOD1P15172 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
MYOD1P15172 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
MYOD1P15172 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
MYOD1P15172 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
MYOD1P15172 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
MYOD1P15172 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
MYOD1P15172 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
MYOD1P15172 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
MYOD1P15172 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
MYOD1P15172 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
MYOD1P15172 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
MYOD1P15172 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
MYOD1P15172 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
MYOD1P15172 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
MYOD1P15172 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
MYOD1P15172 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
MYOD1P15172 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
MYOD1P15172 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
MYOD1P15172 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
MYOD1P15172 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
MYOD1P15172 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
MYOD1P15172 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
MYOD1P15172 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
MYOD1P15172 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
MYOD1P15172 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
MYOD1P15172 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC20.22■□□□□ 0.83
MYOD1P15172 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
MYOD1P15172 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
MYOD1P15172 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
MYOD1P15172 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
MYOD1P15172 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
MYOD1P15172 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
MYOD1P15172 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
MYOD1P15172 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
MYOD1P15172 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
MYOD1P15172 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
MYOD1P15172 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
MYOD1P15172 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
MYOD1P15172 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
MYOD1P15172 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
MYOD1P15172 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
MYOD1P15172 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
MYOD1P15172 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
MYOD1P15172 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
MYOD1P15172 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
MYOD1P15172 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
MYOD1P15172 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
MYOD1P15172 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
MYOD1P15172 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
MYOD1P15172 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
MYOD1P15172 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
MYOD1P15172 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
MYOD1P15172 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.9 ms