Protein–RNA interactions for Protein: P14733

Lmnb1, Lamin-B1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 588 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmnb1P14733 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC28.96■■■□□ 2.23
Lmnb1P14733 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC28.96■■■□□ 2.23
Lmnb1P14733 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC28.96■■■□□ 2.23
Lmnb1P14733 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Lmnb1P14733 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC28.95■■■□□ 2.22
Lmnb1P14733 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
Lmnb1P14733 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
Lmnb1P14733 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Lmnb1P14733 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Lmnb1P14733 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
Lmnb1P14733 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
Lmnb1P14733 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Lmnb1P14733 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
Lmnb1P14733 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
Lmnb1P14733 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Lmnb1P14733 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
Lmnb1P14733 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
Lmnb1P14733 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
Lmnb1P14733 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Lmnb1P14733 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Lmnb1P14733 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
Lmnb1P14733 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Lmnb1P14733 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
Lmnb1P14733 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC28.89■■■□□ 2.22
Lmnb1P14733 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
Lmnb1P14733 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Lmnb1P14733 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Lmnb1P14733 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Lmnb1P14733 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Lmnb1P14733 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Lmnb1P14733 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
Lmnb1P14733 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Lmnb1P14733 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Lmnb1P14733 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Lmnb1P14733 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
Lmnb1P14733 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC28.85■■■□□ 2.21
Lmnb1P14733 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
Lmnb1P14733 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Lmnb1P14733 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Lmnb1P14733 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC28.83■■■□□ 2.21
Lmnb1P14733 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Lmnb1P14733 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.2
Lmnb1P14733 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
Lmnb1P14733 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Lmnb1P14733 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
Lmnb1P14733 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Lmnb1P14733 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Lmnb1P14733 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Lmnb1P14733 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Lmnb1P14733 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
Lmnb1P14733 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Lmnb1P14733 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Lmnb1P14733 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Lmnb1P14733 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
Lmnb1P14733 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Lmnb1P14733 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Lmnb1P14733 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
Lmnb1P14733 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
Lmnb1P14733 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Lmnb1P14733 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Lmnb1P14733 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Lmnb1P14733 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Lmnb1P14733 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
Lmnb1P14733 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Lmnb1P14733 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC28.74■■■□□ 2.19
Lmnb1P14733 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Lmnb1P14733 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Lmnb1P14733 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Lmnb1P14733 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Lmnb1P14733 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC28.71■■■□□ 2.19
Lmnb1P14733 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Lmnb1P14733 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Lmnb1P14733 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Lmnb1P14733 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
Lmnb1P14733 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
Lmnb1P14733 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC28.68■■■□□ 2.18
Lmnb1P14733 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
Lmnb1P14733 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
Lmnb1P14733 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Lmnb1P14733 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC28.67■■■□□ 2.18
Lmnb1P14733 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
Lmnb1P14733 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC28.67■■■□□ 2.18
Lmnb1P14733 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Lmnb1P14733 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC28.67■■■□□ 2.18
Lmnb1P14733 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Lmnb1P14733 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Lmnb1P14733 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC28.63■■■□□ 2.17
Lmnb1P14733 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Lmnb1P14733 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
Lmnb1P14733 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
Lmnb1P14733 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Lmnb1P14733 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Lmnb1P14733 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC28.6■■■□□ 2.17
Lmnb1P14733 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Lmnb1P14733 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC28.6■■■□□ 2.17
Lmnb1P14733 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
Lmnb1P14733 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
Lmnb1P14733 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Lmnb1P14733 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Lmnb1P14733 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.2 ms