Protein–RNA interactions for Protein: P14206

Rpsa, 40S ribosomal protein SA, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 295 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RpsaP14206 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
RpsaP14206 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
RpsaP14206 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RpsaP14206 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RpsaP14206 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RpsaP14206 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RpsaP14206 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RpsaP14206 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RpsaP14206 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RpsaP14206 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RpsaP14206 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RpsaP14206 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RpsaP14206 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RpsaP14206 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RpsaP14206 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RpsaP14206 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RpsaP14206 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RpsaP14206 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
RpsaP14206 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
RpsaP14206 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
RpsaP14206 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
RpsaP14206 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
RpsaP14206 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RpsaP14206 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RpsaP14206 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RpsaP14206 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RpsaP14206 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RpsaP14206 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RpsaP14206 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RpsaP14206 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RpsaP14206 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RpsaP14206 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RpsaP14206 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RpsaP14206 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RpsaP14206 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RpsaP14206 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RpsaP14206 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RpsaP14206 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RpsaP14206 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RpsaP14206 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RpsaP14206 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RpsaP14206 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RpsaP14206 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RpsaP14206 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RpsaP14206 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
RpsaP14206 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RpsaP14206 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RpsaP14206 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RpsaP14206 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RpsaP14206 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RpsaP14206 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RpsaP14206 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RpsaP14206 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RpsaP14206 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RpsaP14206 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
RpsaP14206 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RpsaP14206 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RpsaP14206 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RpsaP14206 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RpsaP14206 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RpsaP14206 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RpsaP14206 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RpsaP14206 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
RpsaP14206 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RpsaP14206 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RpsaP14206 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RpsaP14206 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RpsaP14206 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RpsaP14206 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RpsaP14206 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RpsaP14206 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RpsaP14206 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RpsaP14206 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
RpsaP14206 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RpsaP14206 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RpsaP14206 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RpsaP14206 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RpsaP14206 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RpsaP14206 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RpsaP14206 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RpsaP14206 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RpsaP14206 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RpsaP14206 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RpsaP14206 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RpsaP14206 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RpsaP14206 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RpsaP14206 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
RpsaP14206 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RpsaP14206 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RpsaP14206 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
RpsaP14206 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RpsaP14206 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RpsaP14206 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RpsaP14206 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RpsaP14206 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RpsaP14206 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RpsaP14206 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
RpsaP14206 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
RpsaP14206 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
RpsaP14206 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 130 ms