Protein–RNA interactions for Protein: P13864

Dnmt1, DNA (cytosine-5)-methyltransferase 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,620 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dnmt1P13864 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC37.43■■■■□ 3.58
Dnmt1P13864 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC37.43■■■■□ 3.58
Dnmt1P13864 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC37.42■■■■□ 3.58
Dnmt1P13864 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.41■■■■□ 3.58
Dnmt1P13864 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC37.4■■■■□ 3.58
Dnmt1P13864 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.39■■■■□ 3.58
Dnmt1P13864 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC37.38■■■■□ 3.57
Dnmt1P13864 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC37.37■■■■□ 3.57
Dnmt1P13864 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.36■■■■□ 3.57
Dnmt1P13864 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.36■■■■□ 3.57
Dnmt1P13864 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC37.36■■■■□ 3.57
Dnmt1P13864 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC37.35■■■■□ 3.57
Dnmt1P13864 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC37.34■■■■□ 3.57
Dnmt1P13864 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.34■■■■□ 3.57
Dnmt1P13864 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC37.34■■■■□ 3.57
Dnmt1P13864 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.33■■■■□ 3.57
Dnmt1P13864 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.33■■■■□ 3.57
Dnmt1P13864 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC37.33■■■■□ 3.57
Dnmt1P13864 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC37.33■■■■□ 3.57
Dnmt1P13864 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC37.32■■■■□ 3.57
Dnmt1P13864 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.32■■■■□ 3.57
Dnmt1P13864 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.32■■■■□ 3.56
Dnmt1P13864 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.32■■■■□ 3.56
Dnmt1P13864 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.31■■■■□ 3.56
Dnmt1P13864 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC37.3■■■■□ 3.56
Dnmt1P13864 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC37.3■■■■□ 3.56
Dnmt1P13864 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.29■■■■□ 3.56
Dnmt1P13864 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC37.28■■■■□ 3.56
Dnmt1P13864 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.27■■■■□ 3.56
Dnmt1P13864 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.27■■■■□ 3.56
Dnmt1P13864 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC37.25■■■■□ 3.55
Dnmt1P13864 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC37.25■■■■□ 3.55
Dnmt1P13864 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC37.24■■■■□ 3.55
Dnmt1P13864 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC37.23■■■■□ 3.55
Dnmt1P13864 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC37.22■■■■□ 3.55
Dnmt1P13864 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC37.22■■■■□ 3.55
Dnmt1P13864 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.22■■■■□ 3.55
Dnmt1P13864 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC37.22■■■■□ 3.55
Dnmt1P13864 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC37.21■■■■□ 3.55
Dnmt1P13864 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC37.2■■■■□ 3.55
Dnmt1P13864 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.18■■■■□ 3.54
Dnmt1P13864 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC37.18■■■■□ 3.54
Dnmt1P13864 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC37.18■■■■□ 3.54
Dnmt1P13864 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.18■■■■□ 3.54
Dnmt1P13864 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC37.17■■■■□ 3.54
Dnmt1P13864 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC37.17■■■■□ 3.54
Dnmt1P13864 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC37.17■■■■□ 3.54
Dnmt1P13864 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC37.17■■■■□ 3.54
Dnmt1P13864 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.16■■■■□ 3.54
Dnmt1P13864 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.15■■■■□ 3.54
Dnmt1P13864 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.15■■■■□ 3.54
Dnmt1P13864 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.15■■■■□ 3.54
Dnmt1P13864 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC37.14■■■■□ 3.54
Dnmt1P13864 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.14■■■■□ 3.54
Dnmt1P13864 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC37.14■■■■□ 3.54
Dnmt1P13864 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.14■■■■□ 3.54
Dnmt1P13864 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.13■■■■□ 3.53
Dnmt1P13864 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC37.13■■■■□ 3.53
Dnmt1P13864 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.12■■■■□ 3.53
Dnmt1P13864 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC37.12■■■■□ 3.53
Dnmt1P13864 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC37.12■■■■□ 3.53
Dnmt1P13864 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.12■■■■□ 3.53
Dnmt1P13864 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.11■■■■□ 3.53
Dnmt1P13864 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC37.11■■■■□ 3.53
Dnmt1P13864 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC37.11■■■■□ 3.53
Dnmt1P13864 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC37.1■■■■□ 3.53
Dnmt1P13864 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.1■■■■□ 3.53
Dnmt1P13864 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC37.1■■■■□ 3.53
Dnmt1P13864 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.09■■■■□ 3.53
Dnmt1P13864 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC37.09■■■■□ 3.53
Dnmt1P13864 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC37.09■■■■□ 3.53
Dnmt1P13864 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC37.08■■■■□ 3.53
Dnmt1P13864 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.07■■■■□ 3.53
Dnmt1P13864 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.07■■■■□ 3.52
Dnmt1P13864 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.05■■■■□ 3.52
Dnmt1P13864 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.05■■■■□ 3.52
Dnmt1P13864 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC37.05■■■■□ 3.52
Dnmt1P13864 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.04■■■■□ 3.52
Dnmt1P13864 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC37.03■■■■□ 3.52
Dnmt1P13864 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC37.01■■■■□ 3.52
Dnmt1P13864 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37■■■■□ 3.51
Dnmt1P13864 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC37■■■■□ 3.51
Dnmt1P13864 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC36.99■■■■□ 3.51
Dnmt1P13864 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.99■■■■□ 3.51
Dnmt1P13864 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC36.99■■■■□ 3.51
Dnmt1P13864 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.97■■■■□ 3.51
Dnmt1P13864 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC36.97■■■■□ 3.51
Dnmt1P13864 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC36.97■■■■□ 3.51
Dnmt1P13864 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.96■■■■□ 3.51
Dnmt1P13864 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC36.94■■■■□ 3.5
Dnmt1P13864 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC36.94■■■■□ 3.5
Dnmt1P13864 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC36.92■■■■□ 3.5
Dnmt1P13864 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC36.92■■■■□ 3.5
Dnmt1P13864 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.91■■■■□ 3.5
Dnmt1P13864 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.9■■■■□ 3.5
Dnmt1P13864 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC36.9■■■■□ 3.5
Dnmt1P13864 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC36.9■■■■□ 3.5
Dnmt1P13864 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC36.9■■■■□ 3.5
Dnmt1P13864 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC36.89■■■■□ 3.5
Dnmt1P13864 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC36.89■■■■□ 3.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.5 ms