Protein–RNA interactions for Protein: P13372

Vpreb1, Immunoglobulin iota chain, mousemouse

Predictions only

Length 142 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vpreb1P13372 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Vpreb1P13372 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Vpreb1P13372 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Vpreb1P13372 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Vpreb1P13372 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Vpreb1P13372 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Vpreb1P13372 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Vpreb1P13372 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Vpreb1P13372 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Vpreb1P13372 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Vpreb1P13372 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Vpreb1P13372 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Vpreb1P13372 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Vpreb1P13372 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Vpreb1P13372 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Vpreb1P13372 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Vpreb1P13372 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Vpreb1P13372 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Vpreb1P13372 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Vpreb1P13372 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Vpreb1P13372 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Vpreb1P13372 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Vpreb1P13372 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Vpreb1P13372 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Vpreb1P13372 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Vpreb1P13372 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Vpreb1P13372 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Vpreb1P13372 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Vpreb1P13372 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Vpreb1P13372 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Vpreb1P13372 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Vpreb1P13372 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Vpreb1P13372 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Vpreb1P13372 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Vpreb1P13372 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Vpreb1P13372 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Vpreb1P13372 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Vpreb1P13372 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Vpreb1P13372 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Vpreb1P13372 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Vpreb1P13372 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Vpreb1P13372 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Vpreb1P13372 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Vpreb1P13372 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Vpreb1P13372 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Vpreb1P13372 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Vpreb1P13372 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Vpreb1P13372 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Vpreb1P13372 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Vpreb1P13372 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Vpreb1P13372 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Vpreb1P13372 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Vpreb1P13372 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Vpreb1P13372 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Vpreb1P13372 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Vpreb1P13372 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Vpreb1P13372 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Vpreb1P13372 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Vpreb1P13372 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Vpreb1P13372 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Vpreb1P13372 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Vpreb1P13372 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Vpreb1P13372 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Vpreb1P13372 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Vpreb1P13372 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Vpreb1P13372 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Vpreb1P13372 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Vpreb1P13372 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Vpreb1P13372 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Vpreb1P13372 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Vpreb1P13372 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Vpreb1P13372 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Vpreb1P13372 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Vpreb1P13372 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Vpreb1P13372 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Vpreb1P13372 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Vpreb1P13372 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Vpreb1P13372 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Vpreb1P13372 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Vpreb1P13372 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Vpreb1P13372 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Vpreb1P13372 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Vpreb1P13372 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Vpreb1P13372 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Vpreb1P13372 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Vpreb1P13372 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Vpreb1P13372 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Vpreb1P13372 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Vpreb1P13372 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Vpreb1P13372 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Vpreb1P13372 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Vpreb1P13372 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Vpreb1P13372 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Vpreb1P13372 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Vpreb1P13372 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Vpreb1P13372 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Vpreb1P13372 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Vpreb1P13372 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Vpreb1P13372 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Vpreb1P13372 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 124.7 ms