Protein–RNA interactions for Protein: P13196

ALAS1, 5-aminolevulinate synthase, nonspecific, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 640 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALAS1P13196 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
ALAS1P13196 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
ALAS1P13196 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
ALAS1P13196 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC29.37■■■□□ 2.29
ALAS1P13196 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
ALAS1P13196 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
ALAS1P13196 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
ALAS1P13196 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
ALAS1P13196 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
ALAS1P13196 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
ALAS1P13196 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC29.34■■■□□ 2.29
ALAS1P13196 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
ALAS1P13196 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
ALAS1P13196 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
ALAS1P13196 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
ALAS1P13196 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC29.33■■■□□ 2.29
ALAS1P13196 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
ALAS1P13196 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
ALAS1P13196 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC29.32■■■□□ 2.28
ALAS1P13196 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
ALAS1P13196 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
ALAS1P13196 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
ALAS1P13196 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
ALAS1P13196 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
ALAS1P13196 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
ALAS1P13196 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
ALAS1P13196 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
ALAS1P13196 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
ALAS1P13196 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
ALAS1P13196 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
ALAS1P13196 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC29.3■■■□□ 2.28
ALAS1P13196 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
ALAS1P13196 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC29.29■■■□□ 2.28
ALAS1P13196 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
ALAS1P13196 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC29.28■■■□□ 2.28
ALAS1P13196 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
ALAS1P13196 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC29.28■■■□□ 2.28
ALAS1P13196 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
ALAS1P13196 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC29.26■■■□□ 2.27
ALAS1P13196 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.26■■■□□ 2.27
ALAS1P13196 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
ALAS1P13196 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
ALAS1P13196 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC29.25■■■□□ 2.27
ALAS1P13196 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC29.25■■■□□ 2.27
ALAS1P13196 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC29.24■■■□□ 2.27
ALAS1P13196 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
ALAS1P13196 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
ALAS1P13196 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
ALAS1P13196 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC29.24■■■□□ 2.27
ALAS1P13196 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
ALAS1P13196 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
ALAS1P13196 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
ALAS1P13196 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
ALAS1P13196 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC29.21■■■□□ 2.27
ALAS1P13196 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
ALAS1P13196 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC29.21■■■□□ 2.27
ALAS1P13196 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
ALAS1P13196 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.26
ALAS1P13196 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
ALAS1P13196 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
ALAS1P13196 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC29.18■■■□□ 2.26
ALAS1P13196 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC29.18■■■□□ 2.26
ALAS1P13196 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
ALAS1P13196 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
ALAS1P13196 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
ALAS1P13196 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
ALAS1P13196 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
ALAS1P13196 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC29.15■■■□□ 2.26
ALAS1P13196 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
ALAS1P13196 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC29.15■■■□□ 2.26
ALAS1P13196 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.26
ALAS1P13196 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
ALAS1P13196 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.26
ALAS1P13196 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC29.14■■■□□ 2.26
ALAS1P13196 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC29.13■■■□□ 2.25
ALAS1P13196 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
ALAS1P13196 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC29.13■■■□□ 2.25
ALAS1P13196 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
ALAS1P13196 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
ALAS1P13196 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
ALAS1P13196 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
ALAS1P13196 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
ALAS1P13196 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
ALAS1P13196 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC29.11■■■□□ 2.25
ALAS1P13196 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
ALAS1P13196 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
ALAS1P13196 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
ALAS1P13196 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
ALAS1P13196 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
ALAS1P13196 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
ALAS1P13196 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
ALAS1P13196 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
ALAS1P13196 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
ALAS1P13196 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
ALAS1P13196 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
ALAS1P13196 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
ALAS1P13196 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC29.07■■■□□ 2.24
ALAS1P13196 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC29.06■■■□□ 2.24
ALAS1P13196 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
ALAS1P13196 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.5 ms