Protein–RNA interactions for Protein: P12970

Rpl7a, 60S ribosomal protein L7a, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 266 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl7aP12970 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Rpl7aP12970 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
Rpl7aP12970 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Rpl7aP12970 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Rpl7aP12970 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Rpl7aP12970 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Rpl7aP12970 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Rpl7aP12970 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Rpl7aP12970 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Rpl7aP12970 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Rpl7aP12970 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Rpl7aP12970 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Rpl7aP12970 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Rpl7aP12970 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Rpl7aP12970 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Rpl7aP12970 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Rpl7aP12970 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Rpl7aP12970 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Rpl7aP12970 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Rpl7aP12970 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Rpl7aP12970 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Rpl7aP12970 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Rpl7aP12970 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Rpl7aP12970 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
Rpl7aP12970 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Rpl7aP12970 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Rpl7aP12970 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Rpl7aP12970 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Rpl7aP12970 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Rpl7aP12970 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Rpl7aP12970 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Rpl7aP12970 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Rpl7aP12970 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Rpl7aP12970 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Rpl7aP12970 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Rpl7aP12970 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Rpl7aP12970 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Rpl7aP12970 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Rpl7aP12970 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Rpl7aP12970 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Rpl7aP12970 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Rpl7aP12970 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Rpl7aP12970 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Rpl7aP12970 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Rpl7aP12970 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Rpl7aP12970 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Rpl7aP12970 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Rpl7aP12970 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Rpl7aP12970 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Rpl7aP12970 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Rpl7aP12970 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Rpl7aP12970 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Rpl7aP12970 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Rpl7aP12970 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Rpl7aP12970 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Rpl7aP12970 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Rpl7aP12970 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Rpl7aP12970 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Rpl7aP12970 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.47
Rpl7aP12970 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Rpl7aP12970 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Rpl7aP12970 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Rpl7aP12970 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Rpl7aP12970 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Rpl7aP12970 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Rpl7aP12970 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Rpl7aP12970 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Rpl7aP12970 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Rpl7aP12970 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Rpl7aP12970 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Rpl7aP12970 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Rpl7aP12970 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Rpl7aP12970 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Rpl7aP12970 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Rpl7aP12970 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Rpl7aP12970 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Rpl7aP12970 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Rpl7aP12970 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Rpl7aP12970 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Rpl7aP12970 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
Rpl7aP12970 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Rpl7aP12970 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Rpl7aP12970 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Rpl7aP12970 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Rpl7aP12970 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Rpl7aP12970 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Rpl7aP12970 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Rpl7aP12970 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Rpl7aP12970 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Rpl7aP12970 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Rpl7aP12970 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Rpl7aP12970 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Rpl7aP12970 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Rpl7aP12970 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Rpl7aP12970 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Rpl7aP12970 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Rpl7aP12970 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Rpl7aP12970 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Rpl7aP12970 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Rpl7aP12970 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.5 ms