Protein–RNA interactions for Protein: P11532

DMD, Dystrophin, humanhuman

Predictions only

Length 3,685 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DMDP11532 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
DMDP11532 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
DMDP11532 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
DMDP11532 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
DMDP11532 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
DMDP11532 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
DMDP11532 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
DMDP11532 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
DMDP11532 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
DMDP11532 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
DMDP11532 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
DMDP11532 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
DMDP11532 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
DMDP11532 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
DMDP11532 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
DMDP11532 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
DMDP11532 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
DMDP11532 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
DMDP11532 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
DMDP11532 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
DMDP11532 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
DMDP11532 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
DMDP11532 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
DMDP11532 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
DMDP11532 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC25.65■■□□□ 1.7
DMDP11532 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
DMDP11532 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
DMDP11532 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
DMDP11532 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
DMDP11532 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
DMDP11532 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
DMDP11532 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
DMDP11532 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
DMDP11532 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
DMDP11532 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
DMDP11532 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
DMDP11532 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
DMDP11532 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
DMDP11532 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
DMDP11532 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
DMDP11532 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
DMDP11532 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
DMDP11532 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
DMDP11532 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
DMDP11532 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
DMDP11532 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
DMDP11532 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
DMDP11532 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
DMDP11532 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
DMDP11532 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
DMDP11532 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
DMDP11532 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
DMDP11532 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
DMDP11532 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
DMDP11532 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
DMDP11532 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
DMDP11532 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC25.56■■□□□ 1.68
DMDP11532 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
DMDP11532 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
DMDP11532 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
DMDP11532 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
DMDP11532 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
DMDP11532 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
DMDP11532 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
DMDP11532 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
DMDP11532 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
DMDP11532 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
DMDP11532 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
DMDP11532 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
DMDP11532 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
DMDP11532 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
DMDP11532 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
DMDP11532 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
DMDP11532 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
DMDP11532 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
DMDP11532 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
DMDP11532 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
DMDP11532 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
DMDP11532 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
DMDP11532 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
DMDP11532 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
DMDP11532 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
DMDP11532 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
DMDP11532 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
DMDP11532 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
DMDP11532 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.68
DMDP11532 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
DMDP11532 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
DMDP11532 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
DMDP11532 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
DMDP11532 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
DMDP11532 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
DMDP11532 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
DMDP11532 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
DMDP11532 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
DMDP11532 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
DMDP11532 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
DMDP11532 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
DMDP11532 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
DMDP11532 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.2 ms