Protein–RNA interactions for Protein: P11438

Lamp1, Lysosome-associated membrane glycoprotein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lamp1P11438 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Lamp1P11438 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Lamp1P11438 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Lamp1P11438 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Lamp1P11438 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
Lamp1P11438 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Lamp1P11438 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.89
Lamp1P11438 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Lamp1P11438 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
Lamp1P11438 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Lamp1P11438 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
Lamp1P11438 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Lamp1P11438 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Lamp1P11438 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Lamp1P11438 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Lamp1P11438 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Lamp1P11438 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Lamp1P11438 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Lamp1P11438 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Lamp1P11438 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Lamp1P11438 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Lamp1P11438 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Lamp1P11438 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Lamp1P11438 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Lamp1P11438 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Lamp1P11438 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Lamp1P11438 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Lamp1P11438 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Lamp1P11438 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Lamp1P11438 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Lamp1P11438 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
Lamp1P11438 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
Lamp1P11438 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Lamp1P11438 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
Lamp1P11438 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
Lamp1P11438 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Lamp1P11438 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Lamp1P11438 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Lamp1P11438 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Lamp1P11438 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Lamp1P11438 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Lamp1P11438 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
Lamp1P11438 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Lamp1P11438 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Lamp1P11438 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Lamp1P11438 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
Lamp1P11438 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Lamp1P11438 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Lamp1P11438 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Lamp1P11438 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Lamp1P11438 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Lamp1P11438 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Lamp1P11438 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Lamp1P11438 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Lamp1P11438 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Lamp1P11438 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Lamp1P11438 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Lamp1P11438 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Lamp1P11438 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Lamp1P11438 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Lamp1P11438 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Lamp1P11438 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Lamp1P11438 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
Lamp1P11438 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC26.7■■□□□ 1.86
Lamp1P11438 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC26.7■■□□□ 1.86
Lamp1P11438 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Lamp1P11438 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Lamp1P11438 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Lamp1P11438 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Lamp1P11438 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
Lamp1P11438 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Lamp1P11438 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Lamp1P11438 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Lamp1P11438 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
Lamp1P11438 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Lamp1P11438 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC26.64■■□□□ 1.86
Lamp1P11438 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Lamp1P11438 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
Lamp1P11438 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Lamp1P11438 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Lamp1P11438 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
Lamp1P11438 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Lamp1P11438 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Lamp1P11438 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
Lamp1P11438 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Lamp1P11438 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Lamp1P11438 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Lamp1P11438 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
Lamp1P11438 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Lamp1P11438 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Lamp1P11438 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
Lamp1P11438 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Lamp1P11438 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Lamp1P11438 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Lamp1P11438 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Lamp1P11438 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
Lamp1P11438 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC26.58■■□□□ 1.84
Lamp1P11438 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Lamp1P11438 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Lamp1P11438 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.7 ms