Protein–RNA interactions for Protein: P11378

Tnp2, Nuclear transition protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnp2P11378 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Tnp2P11378 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Tnp2P11378 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Tnp2P11378 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Tnp2P11378 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Tnp2P11378 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Tnp2P11378 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
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Tnp2P11378 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Tnp2P11378 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Tnp2P11378 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Tnp2P11378 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Tnp2P11378 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
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Tnp2P11378 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Tnp2P11378 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Tnp2P11378 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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Tnp2P11378 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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Tnp2P11378 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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Tnp2P11378 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
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Tnp2P11378 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
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Tnp2P11378 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Tnp2P11378 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Tnp2P11378 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Tnp2P11378 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Tnp2P11378 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Tnp2P11378 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Tnp2P11378 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Tnp2P11378 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
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Tnp2P11378 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Tnp2P11378 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
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Tnp2P11378 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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Tnp2P11378 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Tnp2P11378 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Tnp2P11378 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Tnp2P11378 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Tnp2P11378 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Tnp2P11378 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tnp2P11378 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tnp2P11378 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tnp2P11378 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tnp2P11378 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tnp2P11378 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tnp2P11378 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tnp2P11378 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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Tnp2P11378 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Tnp2P11378 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Tnp2P11378 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Tnp2P11378 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Tnp2P11378 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Tnp2P11378 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Tnp2P11378 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Tnp2P11378 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Tnp2P11378 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Tnp2P11378 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Tnp2P11378 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Tnp2P11378 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Tnp2P11378 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Tnp2P11378 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Tnp2P11378 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Tnp2P11378 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Tnp2P11378 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Tnp2P11378 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Tnp2P11378 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Tnp2P11378 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Tnp2P11378 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Tnp2P11378 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Tnp2P11378 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Tnp2P11378 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Tnp2P11378 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Tnp2P11378 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Tnp2P11378 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Tnp2P11378 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Tnp2P11378 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Tnp2P11378 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC14.86□□□□□ -0.03
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