Protein–RNA interactions for Protein: P11277

SPTB, Spectrin beta chain, erythrocytic, humanhuman

Predictions only

Length 2,137 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTBP11277 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SPTBP11277 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SPTBP11277 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SPTBP11277 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SPTBP11277 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
SPTBP11277 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SPTBP11277 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SPTBP11277 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SPTBP11277 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SPTBP11277 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SPTBP11277 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SPTBP11277 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SPTBP11277 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SPTBP11277 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SPTBP11277 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SPTBP11277 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SPTBP11277 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SPTBP11277 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SPTBP11277 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SPTBP11277 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
SPTBP11277 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SPTBP11277 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SPTBP11277 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SPTBP11277 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SPTBP11277 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SPTBP11277 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SPTBP11277 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SPTBP11277 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SPTBP11277 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SPTBP11277 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SPTBP11277 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SPTBP11277 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SPTBP11277 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
SPTBP11277 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SPTBP11277 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SPTBP11277 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SPTBP11277 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SPTBP11277 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SPTBP11277 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SPTBP11277 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SPTBP11277 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SPTBP11277 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SPTBP11277 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SPTBP11277 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SPTBP11277 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SPTBP11277 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SPTBP11277 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SPTBP11277 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SPTBP11277 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
SPTBP11277 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
SPTBP11277 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
SPTBP11277 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
SPTBP11277 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
SPTBP11277 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
SPTBP11277 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
SPTBP11277 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
SPTBP11277 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
SPTBP11277 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SPTBP11277 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SPTBP11277 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SPTBP11277 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SPTBP11277 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SPTBP11277 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SPTBP11277 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SPTBP11277 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SPTBP11277 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SPTBP11277 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SPTBP11277 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SPTBP11277 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SPTBP11277 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SPTBP11277 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SPTBP11277 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SPTBP11277 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SPTBP11277 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
SPTBP11277 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
SPTBP11277 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SPTBP11277 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SPTBP11277 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SPTBP11277 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
SPTBP11277 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SPTBP11277 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SPTBP11277 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
SPTBP11277 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SPTBP11277 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SPTBP11277 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
SPTBP11277 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.46
SPTBP11277 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
SPTBP11277 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SPTBP11277 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SPTBP11277 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SPTBP11277 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SPTBP11277 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SPTBP11277 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
SPTBP11277 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SPTBP11277 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SPTBP11277 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SPTBP11277 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SPTBP11277 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SPTBP11277 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SPTBP11277 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.4 ms