Protein–RNA interactions for Protein: P11216

PYGB, Glycogen phosphorylase, brain form, humanhuman

Predictions only

Length 843 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PYGBP11216 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PYGBP11216 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PYGBP11216 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PYGBP11216 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
PYGBP11216 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC25.39■■□□□ 1.66
PYGBP11216 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
PYGBP11216 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
PYGBP11216 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
PYGBP11216 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
PYGBP11216 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
PYGBP11216 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
PYGBP11216 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PYGBP11216 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PYGBP11216 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PYGBP11216 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PYGBP11216 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PYGBP11216 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PYGBP11216 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PYGBP11216 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PYGBP11216 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PYGBP11216 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PYGBP11216 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PYGBP11216 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
PYGBP11216 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PYGBP11216 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PYGBP11216 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PYGBP11216 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PYGBP11216 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PYGBP11216 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
PYGBP11216 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PYGBP11216 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PYGBP11216 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PYGBP11216 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PYGBP11216 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PYGBP11216 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PYGBP11216 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PYGBP11216 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PYGBP11216 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PYGBP11216 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PYGBP11216 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PYGBP11216 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PYGBP11216 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PYGBP11216 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
PYGBP11216 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PYGBP11216 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PYGBP11216 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PYGBP11216 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PYGBP11216 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PYGBP11216 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PYGBP11216 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
PYGBP11216 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PYGBP11216 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PYGBP11216 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PYGBP11216 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PYGBP11216 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PYGBP11216 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PYGBP11216 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PYGBP11216 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PYGBP11216 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PYGBP11216 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PYGBP11216 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PYGBP11216 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PYGBP11216 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PYGBP11216 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PYGBP11216 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PYGBP11216 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PYGBP11216 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PYGBP11216 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PYGBP11216 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PYGBP11216 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PYGBP11216 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PYGBP11216 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
PYGBP11216 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PYGBP11216 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PYGBP11216 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PYGBP11216 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PYGBP11216 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
PYGBP11216 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PYGBP11216 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PYGBP11216 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PYGBP11216 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PYGBP11216 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PYGBP11216 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PYGBP11216 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PYGBP11216 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PYGBP11216 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PYGBP11216 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PYGBP11216 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PYGBP11216 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PYGBP11216 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PYGBP11216 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PYGBP11216 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
PYGBP11216 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
PYGBP11216 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PYGBP11216 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
PYGBP11216 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
PYGBP11216 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PYGBP11216 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PYGBP11216 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
PYGBP11216 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms