Protein–RNA interactions for Protein: P10589

NR2F1, COUP transcription factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 423 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NR2F1P10589 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
NR2F1P10589 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
NR2F1P10589 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
NR2F1P10589 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
NR2F1P10589 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
NR2F1P10589 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
NR2F1P10589 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
NR2F1P10589 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
NR2F1P10589 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
NR2F1P10589 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
NR2F1P10589 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
NR2F1P10589 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
NR2F1P10589 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
NR2F1P10589 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
NR2F1P10589 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
NR2F1P10589 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
NR2F1P10589 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.38
NR2F1P10589 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
NR2F1P10589 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
NR2F1P10589 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
NR2F1P10589 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
NR2F1P10589 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
NR2F1P10589 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
NR2F1P10589 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
NR2F1P10589 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
NR2F1P10589 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
NR2F1P10589 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
NR2F1P10589 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
NR2F1P10589 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
NR2F1P10589 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
NR2F1P10589 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
NR2F1P10589 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
NR2F1P10589 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
NR2F1P10589 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NR2F1P10589 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NR2F1P10589 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
NR2F1P10589 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
NR2F1P10589 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
NR2F1P10589 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
NR2F1P10589 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
NR2F1P10589 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NR2F1P10589 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NR2F1P10589 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
NR2F1P10589 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
NR2F1P10589 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
NR2F1P10589 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
NR2F1P10589 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
NR2F1P10589 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
NR2F1P10589 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
NR2F1P10589 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
NR2F1P10589 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
NR2F1P10589 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
NR2F1P10589 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
NR2F1P10589 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC23.55■■□□□ 1.36
NR2F1P10589 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
NR2F1P10589 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
NR2F1P10589 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
NR2F1P10589 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
NR2F1P10589 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
NR2F1P10589 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
NR2F1P10589 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
NR2F1P10589 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
NR2F1P10589 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
NR2F1P10589 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC23.53■■□□□ 1.36
NR2F1P10589 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
NR2F1P10589 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
NR2F1P10589 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
NR2F1P10589 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
NR2F1P10589 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
NR2F1P10589 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
NR2F1P10589 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
NR2F1P10589 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
NR2F1P10589 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
NR2F1P10589 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
NR2F1P10589 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
NR2F1P10589 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
NR2F1P10589 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC23.51■■□□□ 1.35
NR2F1P10589 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
NR2F1P10589 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
NR2F1P10589 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
NR2F1P10589 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
NR2F1P10589 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
NR2F1P10589 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
NR2F1P10589 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NR2F1P10589 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NR2F1P10589 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NR2F1P10589 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NR2F1P10589 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NR2F1P10589 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
NR2F1P10589 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NR2F1P10589 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NR2F1P10589 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
NR2F1P10589 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NR2F1P10589 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
NR2F1P10589 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NR2F1P10589 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NR2F1P10589 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NR2F1P10589 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NR2F1P10589 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NR2F1P10589 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.9 ms