Protein–RNA interactions for Protein: P0DP25

CALM3, Calmodulin-3, humanhuman

Predictions only

Length 149 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALM3P0DP25 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
CALM3P0DP25 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC29.72■■■□□ 2.35
CALM3P0DP25 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
CALM3P0DP25 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC29.71■■■□□ 2.35
CALM3P0DP25 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
CALM3P0DP25 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC29.7■■■□□ 2.35
CALM3P0DP25 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
CALM3P0DP25 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.7■■■□□ 2.35
CALM3P0DP25 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC29.7■■■□□ 2.34
CALM3P0DP25 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
CALM3P0DP25 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
CALM3P0DP25 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
CALM3P0DP25 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC29.68■■■□□ 2.34
CALM3P0DP25 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC29.68■■■□□ 2.34
CALM3P0DP25 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
CALM3P0DP25 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
CALM3P0DP25 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC29.68■■■□□ 2.34
CALM3P0DP25 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC29.67■■■□□ 2.34
CALM3P0DP25 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
CALM3P0DP25 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC29.66■■■□□ 2.34
CALM3P0DP25 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC29.66■■■□□ 2.34
CALM3P0DP25 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
CALM3P0DP25 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
CALM3P0DP25 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.65■■■□□ 2.34
CALM3P0DP25 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
CALM3P0DP25 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC29.65■■■□□ 2.34
CALM3P0DP25 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC29.65■■■□□ 2.34
CALM3P0DP25 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC29.65■■■□□ 2.34
CALM3P0DP25 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
CALM3P0DP25 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC29.64■■■□□ 2.34
CALM3P0DP25 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
CALM3P0DP25 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC29.63■■■□□ 2.33
CALM3P0DP25 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
CALM3P0DP25 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC29.63■■■□□ 2.33
CALM3P0DP25 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC29.63■■■□□ 2.33
CALM3P0DP25 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC29.63■■■□□ 2.33
CALM3P0DP25 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC29.62■■■□□ 2.33
CALM3P0DP25 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
CALM3P0DP25 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
CALM3P0DP25 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.62■■■□□ 2.33
CALM3P0DP25 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
CALM3P0DP25 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
CALM3P0DP25 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC29.61■■■□□ 2.33
CALM3P0DP25 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.61■■■□□ 2.33
CALM3P0DP25 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
CALM3P0DP25 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
CALM3P0DP25 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
CALM3P0DP25 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
CALM3P0DP25 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
CALM3P0DP25 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
CALM3P0DP25 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
CALM3P0DP25 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
CALM3P0DP25 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
CALM3P0DP25 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC29.57■■■□□ 2.32
CALM3P0DP25 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
CALM3P0DP25 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
CALM3P0DP25 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
CALM3P0DP25 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.55■■■□□ 2.32
CALM3P0DP25 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
CALM3P0DP25 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
CALM3P0DP25 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
CALM3P0DP25 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
CALM3P0DP25 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
CALM3P0DP25 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
CALM3P0DP25 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
CALM3P0DP25 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC29.54■■■□□ 2.32
CALM3P0DP25 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
CALM3P0DP25 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
CALM3P0DP25 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC29.54■■■□□ 2.32
CALM3P0DP25 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
CALM3P0DP25 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
CALM3P0DP25 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
CALM3P0DP25 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
CALM3P0DP25 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
CALM3P0DP25 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
CALM3P0DP25 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC29.52■■■□□ 2.32
CALM3P0DP25 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC29.52■■■□□ 2.32
CALM3P0DP25 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
CALM3P0DP25 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
CALM3P0DP25 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
CALM3P0DP25 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC29.51■■■□□ 2.31
CALM3P0DP25 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
CALM3P0DP25 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
CALM3P0DP25 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
CALM3P0DP25 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
CALM3P0DP25 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
CALM3P0DP25 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
CALM3P0DP25 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
CALM3P0DP25 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
CALM3P0DP25 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
CALM3P0DP25 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
CALM3P0DP25 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
CALM3P0DP25 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC29.47■■■□□ 2.31
CALM3P0DP25 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC29.47■■■□□ 2.31
CALM3P0DP25 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
CALM3P0DP25 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
CALM3P0DP25 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC29.46■■■□□ 2.31
CALM3P0DP25 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC29.46■■■□□ 2.31
CALM3P0DP25 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC29.46■■■□□ 2.31
CALM3P0DP25 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.4 ms