Protein–RNA interactions for Protein: P0DN76

U2AF1L5, Splicing factor U2AF 35 kDa subunit-like protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 240 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
U2AF1L5P0DN76 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC34■■■■□ 3.03
U2AF1L5P0DN76 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
U2AF1L5P0DN76 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC33.98■■■■□ 3.03
U2AF1L5P0DN76 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
U2AF1L5P0DN76 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
U2AF1L5P0DN76 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC33.98■■■■□ 3.03
U2AF1L5P0DN76 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.97■■■■□ 3.03
U2AF1L5P0DN76 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
U2AF1L5P0DN76 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
U2AF1L5P0DN76 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
U2AF1L5P0DN76 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC33.95■■■■□ 3.03
U2AF1L5P0DN76 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
U2AF1L5P0DN76 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
U2AF1L5P0DN76 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC33.93■■■■□ 3.02
U2AF1L5P0DN76 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.93■■■■□ 3.02
U2AF1L5P0DN76 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
U2AF1L5P0DN76 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
U2AF1L5P0DN76 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC33.92■■■■□ 3.02
U2AF1L5P0DN76 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC33.92■■■■□ 3.02
U2AF1L5P0DN76 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.92■■■■□ 3.02
U2AF1L5P0DN76 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
U2AF1L5P0DN76 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
U2AF1L5P0DN76 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
U2AF1L5P0DN76 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
U2AF1L5P0DN76 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
U2AF1L5P0DN76 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
U2AF1L5P0DN76 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC33.9■■■■□ 3.02
U2AF1L5P0DN76 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
U2AF1L5P0DN76 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC33.89■■■■□ 3.02
U2AF1L5P0DN76 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC33.89■■■■□ 3.02
U2AF1L5P0DN76 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
U2AF1L5P0DN76 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
U2AF1L5P0DN76 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.88■■■■□ 3.01
U2AF1L5P0DN76 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC33.88■■■■□ 3.01
U2AF1L5P0DN76 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC33.88■■■■□ 3.01
U2AF1L5P0DN76 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC33.88■■■■□ 3.01
U2AF1L5P0DN76 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.88■■■■□ 3.01
U2AF1L5P0DN76 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.87■■■■□ 3.01
U2AF1L5P0DN76 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
U2AF1L5P0DN76 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
U2AF1L5P0DN76 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
U2AF1L5P0DN76 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
U2AF1L5P0DN76 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
U2AF1L5P0DN76 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC33.86■■■■□ 3.01
U2AF1L5P0DN76 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
U2AF1L5P0DN76 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
U2AF1L5P0DN76 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC33.85■■■■□ 3.01
U2AF1L5P0DN76 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
U2AF1L5P0DN76 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
U2AF1L5P0DN76 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC33.83■■■■□ 3.01
U2AF1L5P0DN76 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC33.83■■■■□ 3.01
U2AF1L5P0DN76 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.82■■■■□ 3
U2AF1L5P0DN76 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC33.82■■■■□ 3
U2AF1L5P0DN76 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC33.81■■■■□ 3
U2AF1L5P0DN76 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
U2AF1L5P0DN76 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
U2AF1L5P0DN76 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
U2AF1L5P0DN76 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC33.8■■■■□ 3
U2AF1L5P0DN76 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC33.8■■■■□ 3
U2AF1L5P0DN76 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
U2AF1L5P0DN76 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.8■■■■□ 3
U2AF1L5P0DN76 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
U2AF1L5P0DN76 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
U2AF1L5P0DN76 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
U2AF1L5P0DN76 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC33.79■■■■□ 3
U2AF1L5P0DN76 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC33.77■■■■□ 3
U2AF1L5P0DN76 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
U2AF1L5P0DN76 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC33.76■■■■□ 3
U2AF1L5P0DN76 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.76■■■■□ 3
U2AF1L5P0DN76 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.76■■■□□ 2.99
U2AF1L5P0DN76 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
U2AF1L5P0DN76 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
U2AF1L5P0DN76 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC33.75■■■□□ 2.99
U2AF1L5P0DN76 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
U2AF1L5P0DN76 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.73■■■□□ 2.99
U2AF1L5P0DN76 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
U2AF1L5P0DN76 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.73■■■□□ 2.99
U2AF1L5P0DN76 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
U2AF1L5P0DN76 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
U2AF1L5P0DN76 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
U2AF1L5P0DN76 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
U2AF1L5P0DN76 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
U2AF1L5P0DN76 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
U2AF1L5P0DN76 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
U2AF1L5P0DN76 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
U2AF1L5P0DN76 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
U2AF1L5P0DN76 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
U2AF1L5P0DN76 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC33.71■■■□□ 2.99
U2AF1L5P0DN76 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC33.71■■■□□ 2.99
U2AF1L5P0DN76 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC33.7■■■□□ 2.99
U2AF1L5P0DN76 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.7■■■□□ 2.99
U2AF1L5P0DN76 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC33.7■■■□□ 2.99
U2AF1L5P0DN76 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
U2AF1L5P0DN76 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC33.69■■■□□ 2.98
U2AF1L5P0DN76 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
U2AF1L5P0DN76 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
U2AF1L5P0DN76 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
U2AF1L5P0DN76 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
U2AF1L5P0DN76 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC33.67■■■□□ 2.98
U2AF1L5P0DN76 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC33.67■■■□□ 2.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52 ms