Protein–RNA interactions for Protein: P0DN34

Ndufb1, NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 beta subcomplex subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 57 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ndufb1P0DN34 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ndufb1P0DN34 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Ndufb1P0DN34 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ndufb1P0DN34 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ndufb1P0DN34 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ndufb1P0DN34 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ndufb1P0DN34 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ndufb1P0DN34 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ndufb1P0DN34 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ndufb1P0DN34 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ndufb1P0DN34 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ndufb1P0DN34 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ndufb1P0DN34 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ndufb1P0DN34 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ndufb1P0DN34 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ndufb1P0DN34 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ndufb1P0DN34 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ndufb1P0DN34 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ndufb1P0DN34 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ndufb1P0DN34 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ndufb1P0DN34 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ndufb1P0DN34 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ndufb1P0DN34 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ndufb1P0DN34 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ndufb1P0DN34 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ndufb1P0DN34 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ndufb1P0DN34 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ndufb1P0DN34 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ndufb1P0DN34 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ndufb1P0DN34 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ndufb1P0DN34 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ndufb1P0DN34 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ndufb1P0DN34 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ndufb1P0DN34 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Ndufb1P0DN34 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Ndufb1P0DN34 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ndufb1P0DN34 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ndufb1P0DN34 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ndufb1P0DN34 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ndufb1P0DN34 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ndufb1P0DN34 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ndufb1P0DN34 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ndufb1P0DN34 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ndufb1P0DN34 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ndufb1P0DN34 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ndufb1P0DN34 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ndufb1P0DN34 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ndufb1P0DN34 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ndufb1P0DN34 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ndufb1P0DN34 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ndufb1P0DN34 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ndufb1P0DN34 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ndufb1P0DN34 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ndufb1P0DN34 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ndufb1P0DN34 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ndufb1P0DN34 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ndufb1P0DN34 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ndufb1P0DN34 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ndufb1P0DN34 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ndufb1P0DN34 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ndufb1P0DN34 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ndufb1P0DN34 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ndufb1P0DN34 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ndufb1P0DN34 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ndufb1P0DN34 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ndufb1P0DN34 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ndufb1P0DN34 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ndufb1P0DN34 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ndufb1P0DN34 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
Ndufb1P0DN34 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ndufb1P0DN34 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ndufb1P0DN34 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ndufb1P0DN34 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ndufb1P0DN34 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ndufb1P0DN34 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ndufb1P0DN34 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ndufb1P0DN34 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ndufb1P0DN34 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ndufb1P0DN34 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ndufb1P0DN34 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ndufb1P0DN34 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ndufb1P0DN34 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ndufb1P0DN34 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ndufb1P0DN34 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ndufb1P0DN34 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ndufb1P0DN34 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ndufb1P0DN34 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ndufb1P0DN34 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ndufb1P0DN34 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ndufb1P0DN34 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ndufb1P0DN34 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ndufb1P0DN34 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ndufb1P0DN34 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ndufb1P0DN34 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ndufb1P0DN34 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ndufb1P0DN34 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ndufb1P0DN34 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ndufb1P0DN34 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ndufb1P0DN34 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ndufb1P0DN34 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
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