Protein–RNA interactions for Protein: P0DJI8

SAA1, Serum amyloid A-1 protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 122 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAA1P0DJI8 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
SAA1P0DJI8 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SAA1P0DJI8 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SAA1P0DJI8 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SAA1P0DJI8 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SAA1P0DJI8 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SAA1P0DJI8 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SAA1P0DJI8 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SAA1P0DJI8 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SAA1P0DJI8 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SAA1P0DJI8 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SAA1P0DJI8 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
SAA1P0DJI8 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SAA1P0DJI8 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SAA1P0DJI8 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SAA1P0DJI8 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.85
SAA1P0DJI8 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
SAA1P0DJI8 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SAA1P0DJI8 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SAA1P0DJI8 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
SAA1P0DJI8 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SAA1P0DJI8 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SAA1P0DJI8 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
SAA1P0DJI8 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SAA1P0DJI8 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SAA1P0DJI8 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SAA1P0DJI8 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SAA1P0DJI8 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SAA1P0DJI8 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SAA1P0DJI8 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SAA1P0DJI8 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SAA1P0DJI8 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SAA1P0DJI8 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SAA1P0DJI8 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SAA1P0DJI8 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SAA1P0DJI8 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SAA1P0DJI8 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SAA1P0DJI8 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SAA1P0DJI8 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SAA1P0DJI8 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SAA1P0DJI8 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SAA1P0DJI8 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SAA1P0DJI8 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SAA1P0DJI8 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SAA1P0DJI8 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SAA1P0DJI8 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC20.33■□□□□ 0.85
SAA1P0DJI8 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
SAA1P0DJI8 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SAA1P0DJI8 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SAA1P0DJI8 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SAA1P0DJI8 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SAA1P0DJI8 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SAA1P0DJI8 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SAA1P0DJI8 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SAA1P0DJI8 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SAA1P0DJI8 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SAA1P0DJI8 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SAA1P0DJI8 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SAA1P0DJI8 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
SAA1P0DJI8 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SAA1P0DJI8 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SAA1P0DJI8 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SAA1P0DJI8 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SAA1P0DJI8 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SAA1P0DJI8 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SAA1P0DJI8 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SAA1P0DJI8 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SAA1P0DJI8 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SAA1P0DJI8 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SAA1P0DJI8 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SAA1P0DJI8 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SAA1P0DJI8 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SAA1P0DJI8 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SAA1P0DJI8 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SAA1P0DJI8 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SAA1P0DJI8 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SAA1P0DJI8 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SAA1P0DJI8 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SAA1P0DJI8 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SAA1P0DJI8 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SAA1P0DJI8 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SAA1P0DJI8 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SAA1P0DJI8 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SAA1P0DJI8 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SAA1P0DJI8 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SAA1P0DJI8 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SAA1P0DJI8 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
SAA1P0DJI8 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
SAA1P0DJI8 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SAA1P0DJI8 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SAA1P0DJI8 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SAA1P0DJI8 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SAA1P0DJI8 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SAA1P0DJI8 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SAA1P0DJI8 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SAA1P0DJI8 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SAA1P0DJI8 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SAA1P0DJI8 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SAA1P0DJI8 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SAA1P0DJI8 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.6 ms