Protein–RNA interactions for Protein: P0CJ79

ZNF888, Zinc finger protein 888, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF888P0CJ79 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ZNF888P0CJ79 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ZNF888P0CJ79 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ZNF888P0CJ79 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ZNF888P0CJ79 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ZNF888P0CJ79 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
ZNF888P0CJ79 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ZNF888P0CJ79 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ZNF888P0CJ79 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ZNF888P0CJ79 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ZNF888P0CJ79 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ZNF888P0CJ79 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
ZNF888P0CJ79 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ZNF888P0CJ79 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
ZNF888P0CJ79 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ZNF888P0CJ79 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
ZNF888P0CJ79 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
ZNF888P0CJ79 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ZNF888P0CJ79 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ZNF888P0CJ79 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ZNF888P0CJ79 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ZNF888P0CJ79 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ZNF888P0CJ79 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
ZNF888P0CJ79 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ZNF888P0CJ79 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ZNF888P0CJ79 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ZNF888P0CJ79 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ZNF888P0CJ79 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ZNF888P0CJ79 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ZNF888P0CJ79 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ZNF888P0CJ79 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ZNF888P0CJ79 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ZNF888P0CJ79 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ZNF888P0CJ79 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
ZNF888P0CJ79 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
ZNF888P0CJ79 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ZNF888P0CJ79 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ZNF888P0CJ79 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ZNF888P0CJ79 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ZNF888P0CJ79 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ZNF888P0CJ79 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ZNF888P0CJ79 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ZNF888P0CJ79 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
ZNF888P0CJ79 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ZNF888P0CJ79 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ZNF888P0CJ79 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ZNF888P0CJ79 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
ZNF888P0CJ79 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ZNF888P0CJ79 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ZNF888P0CJ79 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ZNF888P0CJ79 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
ZNF888P0CJ79 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ZNF888P0CJ79 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ZNF888P0CJ79 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ZNF888P0CJ79 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ZNF888P0CJ79 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ZNF888P0CJ79 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ZNF888P0CJ79 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ZNF888P0CJ79 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ZNF888P0CJ79 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ZNF888P0CJ79 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ZNF888P0CJ79 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ZNF888P0CJ79 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ZNF888P0CJ79 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ZNF888P0CJ79 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ZNF888P0CJ79 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ZNF888P0CJ79 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ZNF888P0CJ79 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ZNF888P0CJ79 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ZNF888P0CJ79 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ZNF888P0CJ79 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ZNF888P0CJ79 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ZNF888P0CJ79 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ZNF888P0CJ79 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ZNF888P0CJ79 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ZNF888P0CJ79 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
ZNF888P0CJ79 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
ZNF888P0CJ79 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
ZNF888P0CJ79 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
ZNF888P0CJ79 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ZNF888P0CJ79 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
ZNF888P0CJ79 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
ZNF888P0CJ79 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
ZNF888P0CJ79 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ZNF888P0CJ79 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
ZNF888P0CJ79 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ZNF888P0CJ79 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
ZNF888P0CJ79 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
ZNF888P0CJ79 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ZNF888P0CJ79 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ZNF888P0CJ79 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ZNF888P0CJ79 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
ZNF888P0CJ79 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
ZNF888P0CJ79 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
ZNF888P0CJ79 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
ZNF888P0CJ79 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
ZNF888P0CJ79 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
ZNF888P0CJ79 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
ZNF888P0CJ79 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
ZNF888P0CJ79 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76.8 ms