Protein–RNA interactions for Protein: P0C8K7

Smim1, Small integral membrane protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 78 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim1P0C8K7 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Smim1P0C8K7 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Smim1P0C8K7 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Smim1P0C8K7 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Smim1P0C8K7 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Smim1P0C8K7 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Smim1P0C8K7 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Smim1P0C8K7 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Smim1P0C8K7 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Smim1P0C8K7 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Smim1P0C8K7 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Smim1P0C8K7 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC16.14■□□□□ 0.18
Smim1P0C8K7 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Smim1P0C8K7 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Smim1P0C8K7 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Smim1P0C8K7 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Smim1P0C8K7 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Smim1P0C8K7 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Smim1P0C8K7 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Smim1P0C8K7 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Smim1P0C8K7 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Smim1P0C8K7 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Smim1P0C8K7 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Smim1P0C8K7 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Smim1P0C8K7 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Smim1P0C8K7 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Smim1P0C8K7 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Smim1P0C8K7 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Smim1P0C8K7 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Smim1P0C8K7 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Smim1P0C8K7 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Smim1P0C8K7 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Smim1P0C8K7 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Smim1P0C8K7 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Smim1P0C8K7 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Smim1P0C8K7 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Smim1P0C8K7 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Smim1P0C8K7 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Smim1P0C8K7 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Smim1P0C8K7 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Smim1P0C8K7 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Smim1P0C8K7 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Smim1P0C8K7 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Smim1P0C8K7 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Smim1P0C8K7 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Smim1P0C8K7 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Smim1P0C8K7 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Smim1P0C8K7 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Smim1P0C8K7 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Smim1P0C8K7 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Smim1P0C8K7 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Smim1P0C8K7 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Smim1P0C8K7 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Smim1P0C8K7 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Smim1P0C8K7 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Smim1P0C8K7 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Smim1P0C8K7 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Smim1P0C8K7 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Smim1P0C8K7 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Smim1P0C8K7 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Smim1P0C8K7 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Smim1P0C8K7 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Smim1P0C8K7 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Smim1P0C8K7 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Smim1P0C8K7 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Smim1P0C8K7 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Smim1P0C8K7 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Smim1P0C8K7 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Smim1P0C8K7 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Smim1P0C8K7 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Smim1P0C8K7 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Smim1P0C8K7 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Smim1P0C8K7 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Smim1P0C8K7 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Smim1P0C8K7 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Smim1P0C8K7 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Smim1P0C8K7 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Smim1P0C8K7 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Smim1P0C8K7 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Smim1P0C8K7 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Smim1P0C8K7 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Smim1P0C8K7 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Smim1P0C8K7 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Smim1P0C8K7 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Smim1P0C8K7 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Smim1P0C8K7 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Smim1P0C8K7 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Smim1P0C8K7 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Smim1P0C8K7 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Smim1P0C8K7 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Smim1P0C8K7 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Smim1P0C8K7 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Smim1P0C8K7 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Smim1P0C8K7 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Smim1P0C8K7 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Smim1P0C8K7 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Smim1P0C8K7 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Smim1P0C8K7 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Smim1P0C8K7 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Smim1P0C8K7 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.9 ms