Protein–RNA interactions for Protein: P0C0L4

C4A, Complement C4-A, humanhuman

Predictions only

Length 1,744 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C4AP0C0L4 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC32.63■■■□□ 2.81
C4AP0C0L4 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
C4AP0C0L4 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
C4AP0C0L4 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
C4AP0C0L4 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.62■■■□□ 2.81
C4AP0C0L4 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
C4AP0C0L4 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.6■■■□□ 2.81
C4AP0C0L4 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
C4AP0C0L4 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC32.6■■■□□ 2.81
C4AP0C0L4 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC32.6■■■□□ 2.81
C4AP0C0L4 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
C4AP0C0L4 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC32.59■■■□□ 2.81
C4AP0C0L4 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
C4AP0C0L4 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
C4AP0C0L4 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
C4AP0C0L4 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.81
C4AP0C0L4 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.57■■■□□ 2.81
C4AP0C0L4 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.81
C4AP0C0L4 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC32.57■■■□□ 2.81
C4AP0C0L4 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.81
C4AP0C0L4 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
C4AP0C0L4 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
C4AP0C0L4 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC32.56■■■□□ 2.8
C4AP0C0L4 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC32.56■■■□□ 2.8
C4AP0C0L4 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
C4AP0C0L4 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
C4AP0C0L4 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
C4AP0C0L4 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
C4AP0C0L4 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
C4AP0C0L4 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC32.54■■■□□ 2.8
C4AP0C0L4 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC32.54■■■□□ 2.8
C4AP0C0L4 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
C4AP0C0L4 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
C4AP0C0L4 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC32.53■■■□□ 2.8
C4AP0C0L4 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
C4AP0C0L4 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC32.53■■■□□ 2.8
C4AP0C0L4 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC32.52■■■□□ 2.8
C4AP0C0L4 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC32.52■■■□□ 2.8
C4AP0C0L4 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC32.52■■■□□ 2.8
C4AP0C0L4 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
C4AP0C0L4 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC32.52■■■□□ 2.8
C4AP0C0L4 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
C4AP0C0L4 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.51■■■□□ 2.8
C4AP0C0L4 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.79
C4AP0C0L4 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
C4AP0C0L4 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC32.5■■■□□ 2.79
C4AP0C0L4 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC32.49■■■□□ 2.79
C4AP0C0L4 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC32.49■■■□□ 2.79
C4AP0C0L4 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC32.48■■■□□ 2.79
C4AP0C0L4 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
C4AP0C0L4 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
C4AP0C0L4 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.48■■■□□ 2.79
C4AP0C0L4 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC32.48■■■□□ 2.79
C4AP0C0L4 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
C4AP0C0L4 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC32.48■■■□□ 2.79
C4AP0C0L4 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
C4AP0C0L4 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC32.46■■■□□ 2.79
C4AP0C0L4 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC32.46■■■□□ 2.79
C4AP0C0L4 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC32.45■■■□□ 2.78
C4AP0C0L4 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.45■■■□□ 2.78
C4AP0C0L4 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC32.45■■■□□ 2.78
C4AP0C0L4 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC32.44■■■□□ 2.78
C4AP0C0L4 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC32.44■■■□□ 2.78
C4AP0C0L4 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC32.44■■■□□ 2.78
C4AP0C0L4 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
C4AP0C0L4 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
C4AP0C0L4 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC32.4■■■□□ 2.78
C4AP0C0L4 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
C4AP0C0L4 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
C4AP0C0L4 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
C4AP0C0L4 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC32.4■■■□□ 2.78
C4AP0C0L4 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
C4AP0C0L4 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
C4AP0C0L4 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
C4AP0C0L4 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
C4AP0C0L4 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.37■■■□□ 2.77
C4AP0C0L4 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
C4AP0C0L4 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
C4AP0C0L4 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
C4AP0C0L4 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC32.36■■■□□ 2.77
C4AP0C0L4 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
C4AP0C0L4 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
C4AP0C0L4 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
C4AP0C0L4 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
C4AP0C0L4 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
C4AP0C0L4 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC32.33■■■□□ 2.77
C4AP0C0L4 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
C4AP0C0L4 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC32.33■■■□□ 2.77
C4AP0C0L4 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC32.32■■■□□ 2.76
C4AP0C0L4 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC32.32■■■□□ 2.76
C4AP0C0L4 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
C4AP0C0L4 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC32.31■■■□□ 2.76
C4AP0C0L4 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC32.31■■■□□ 2.76
C4AP0C0L4 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
C4AP0C0L4 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC32.3■■■□□ 2.76
C4AP0C0L4 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC32.3■■■□□ 2.76
C4AP0C0L4 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
C4AP0C0L4 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
C4AP0C0L4 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
C4AP0C0L4 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 86.7 ms