Protein–RNA interactions for Protein: P0C091

FREM3, FRAS1-related extracellular matrix protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 2,139 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FREM3P0C091 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.31
FREM3P0C091 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
FREM3P0C091 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
FREM3P0C091 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
FREM3P0C091 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
FREM3P0C091 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
FREM3P0C091 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
FREM3P0C091 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
FREM3P0C091 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
FREM3P0C091 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
FREM3P0C091 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
FREM3P0C091 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
FREM3P0C091 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
FREM3P0C091 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
FREM3P0C091 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
FREM3P0C091 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
FREM3P0C091 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
FREM3P0C091 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
FREM3P0C091 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
FREM3P0C091 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
FREM3P0C091 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
FREM3P0C091 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
FREM3P0C091 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
FREM3P0C091 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
FREM3P0C091 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
FREM3P0C091 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
FREM3P0C091 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
FREM3P0C091 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
FREM3P0C091 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
FREM3P0C091 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
FREM3P0C091 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
FREM3P0C091 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
FREM3P0C091 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
FREM3P0C091 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
FREM3P0C091 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
FREM3P0C091 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
FREM3P0C091 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
FREM3P0C091 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
FREM3P0C091 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
FREM3P0C091 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
FREM3P0C091 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
FREM3P0C091 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
FREM3P0C091 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
FREM3P0C091 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
FREM3P0C091 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
FREM3P0C091 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
FREM3P0C091 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
FREM3P0C091 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
FREM3P0C091 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
FREM3P0C091 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
FREM3P0C091 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
FREM3P0C091 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
FREM3P0C091 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
FREM3P0C091 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
FREM3P0C091 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
FREM3P0C091 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
FREM3P0C091 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
FREM3P0C091 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
FREM3P0C091 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
FREM3P0C091 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
FREM3P0C091 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
FREM3P0C091 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
FREM3P0C091 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
FREM3P0C091 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
FREM3P0C091 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
FREM3P0C091 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
FREM3P0C091 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
FREM3P0C091 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
FREM3P0C091 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
FREM3P0C091 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
FREM3P0C091 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
FREM3P0C091 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
FREM3P0C091 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
FREM3P0C091 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
FREM3P0C091 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
FREM3P0C091 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
FREM3P0C091 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
FREM3P0C091 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
FREM3P0C091 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
FREM3P0C091 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
FREM3P0C091 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
FREM3P0C091 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
FREM3P0C091 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
FREM3P0C091 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
FREM3P0C091 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
FREM3P0C091 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC23■■□□□ 1.27
FREM3P0C091 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
FREM3P0C091 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
FREM3P0C091 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
FREM3P0C091 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
FREM3P0C091 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
FREM3P0C091 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
FREM3P0C091 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
FREM3P0C091 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
FREM3P0C091 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
FREM3P0C091 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
FREM3P0C091 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
FREM3P0C091 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
FREM3P0C091 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
FREM3P0C091 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80.2 ms