Protein–RNA interactions for Protein: P08294

SOD3, Extracellular superoxide dismutase [Cu-Zn], humanhuman

Predictions only

Length 240 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOD3P08294 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SOD3P08294 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SOD3P08294 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SOD3P08294 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SOD3P08294 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SOD3P08294 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SOD3P08294 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SOD3P08294 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SOD3P08294 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SOD3P08294 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SOD3P08294 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SOD3P08294 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SOD3P08294 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SOD3P08294 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SOD3P08294 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SOD3P08294 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SOD3P08294 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SOD3P08294 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SOD3P08294 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SOD3P08294 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SOD3P08294 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SOD3P08294 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SOD3P08294 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SOD3P08294 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SOD3P08294 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SOD3P08294 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SOD3P08294 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
SOD3P08294 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SOD3P08294 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SOD3P08294 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SOD3P08294 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SOD3P08294 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SOD3P08294 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SOD3P08294 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SOD3P08294 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SOD3P08294 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SOD3P08294 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SOD3P08294 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SOD3P08294 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SOD3P08294 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SOD3P08294 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SOD3P08294 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SOD3P08294 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SOD3P08294 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SOD3P08294 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SOD3P08294 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
SOD3P08294 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SOD3P08294 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SOD3P08294 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SOD3P08294 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SOD3P08294 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SOD3P08294 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SOD3P08294 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SOD3P08294 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SOD3P08294 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SOD3P08294 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SOD3P08294 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SOD3P08294 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SOD3P08294 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SOD3P08294 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SOD3P08294 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SOD3P08294 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SOD3P08294 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SOD3P08294 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SOD3P08294 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SOD3P08294 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SOD3P08294 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
SOD3P08294 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
SOD3P08294 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SOD3P08294 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SOD3P08294 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SOD3P08294 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SOD3P08294 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SOD3P08294 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SOD3P08294 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SOD3P08294 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
SOD3P08294 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SOD3P08294 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SOD3P08294 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SOD3P08294 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
SOD3P08294 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SOD3P08294 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SOD3P08294 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SOD3P08294 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
SOD3P08294 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SOD3P08294 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SOD3P08294 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SOD3P08294 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SOD3P08294 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SOD3P08294 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SOD3P08294 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SOD3P08294 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SOD3P08294 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SOD3P08294 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SOD3P08294 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SOD3P08294 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SOD3P08294 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SOD3P08294 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SOD3P08294 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SOD3P08294 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.4 ms