Protein–RNA interactions for Protein: P08122

Col4a2, Collagen alpha-2(IV) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,707 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col4a2P08122 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Col4a2P08122 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Col4a2P08122 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Col4a2P08122 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Col4a2P08122 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Col4a2P08122 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Col4a2P08122 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Col4a2P08122 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Col4a2P08122 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Col4a2P08122 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Col4a2P08122 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Col4a2P08122 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Col4a2P08122 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Col4a2P08122 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Col4a2P08122 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Col4a2P08122 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Col4a2P08122 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Col4a2P08122 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Col4a2P08122 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Col4a2P08122 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Col4a2P08122 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Col4a2P08122 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Col4a2P08122 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Col4a2P08122 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Col4a2P08122 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Col4a2P08122 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Col4a2P08122 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Col4a2P08122 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Col4a2P08122 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Col4a2P08122 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Col4a2P08122 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Col4a2P08122 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Col4a2P08122 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Col4a2P08122 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Col4a2P08122 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Col4a2P08122 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Col4a2P08122 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Col4a2P08122 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Col4a2P08122 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Col4a2P08122 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Col4a2P08122 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Col4a2P08122 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Col4a2P08122 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Col4a2P08122 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Col4a2P08122 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Col4a2P08122 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Col4a2P08122 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Col4a2P08122 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Col4a2P08122 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Col4a2P08122 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Col4a2P08122 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Col4a2P08122 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Col4a2P08122 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Col4a2P08122 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Col4a2P08122 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Col4a2P08122 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Col4a2P08122 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Col4a2P08122 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Col4a2P08122 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Col4a2P08122 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Col4a2P08122 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Col4a2P08122 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Col4a2P08122 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Col4a2P08122 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Col4a2P08122 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Col4a2P08122 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Col4a2P08122 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Col4a2P08122 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Col4a2P08122 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Col4a2P08122 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Col4a2P08122 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Col4a2P08122 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Col4a2P08122 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Col4a2P08122 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Col4a2P08122 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Col4a2P08122 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Col4a2P08122 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Col4a2P08122 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Col4a2P08122 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Col4a2P08122 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Col4a2P08122 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Col4a2P08122 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Col4a2P08122 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Col4a2P08122 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Col4a2P08122 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Col4a2P08122 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Col4a2P08122 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Col4a2P08122 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Col4a2P08122 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Col4a2P08122 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Col4a2P08122 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Col4a2P08122 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Col4a2P08122 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Col4a2P08122 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Col4a2P08122 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Col4a2P08122 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Col4a2P08122 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Col4a2P08122 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Col4a2P08122 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Col4a2P08122 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 92.7 ms