Protein–RNA interactions for Protein: P07951

TPM2, Tropomyosin beta chain, humanhuman

Predictions only

Length 284 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPM2P07951 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
TPM2P07951 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
TPM2P07951 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC28.51■■■□□ 2.15
TPM2P07951 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
TPM2P07951 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
TPM2P07951 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
TPM2P07951 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
TPM2P07951 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC28.5■■■□□ 2.15
TPM2P07951 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
TPM2P07951 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC28.5■■■□□ 2.15
TPM2P07951 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
TPM2P07951 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
TPM2P07951 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
TPM2P07951 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
TPM2P07951 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
TPM2P07951 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
TPM2P07951 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
TPM2P07951 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC28.47■■■□□ 2.15
TPM2P07951 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
TPM2P07951 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.46■■■□□ 2.15
TPM2P07951 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC28.45■■■□□ 2.15
TPM2P07951 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
TPM2P07951 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
TPM2P07951 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
TPM2P07951 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
TPM2P07951 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
TPM2P07951 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
TPM2P07951 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
TPM2P07951 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
TPM2P07951 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC28.43■■■□□ 2.14
TPM2P07951 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
TPM2P07951 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
TPM2P07951 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
TPM2P07951 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
TPM2P07951 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
TPM2P07951 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
TPM2P07951 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
TPM2P07951 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
TPM2P07951 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
TPM2P07951 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
TPM2P07951 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
TPM2P07951 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
TPM2P07951 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
TPM2P07951 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
TPM2P07951 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
TPM2P07951 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
TPM2P07951 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC28.37■■■□□ 2.13
TPM2P07951 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
TPM2P07951 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
TPM2P07951 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
TPM2P07951 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
TPM2P07951 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
TPM2P07951 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
TPM2P07951 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
TPM2P07951 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
TPM2P07951 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
TPM2P07951 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
TPM2P07951 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
TPM2P07951 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
TPM2P07951 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
TPM2P07951 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
TPM2P07951 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
TPM2P07951 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
TPM2P07951 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.12
TPM2P07951 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
TPM2P07951 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
TPM2P07951 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
TPM2P07951 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
TPM2P07951 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
TPM2P07951 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
TPM2P07951 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
TPM2P07951 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
TPM2P07951 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
TPM2P07951 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
TPM2P07951 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
TPM2P07951 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
TPM2P07951 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
TPM2P07951 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
TPM2P07951 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
TPM2P07951 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
TPM2P07951 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
TPM2P07951 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
TPM2P07951 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
TPM2P07951 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
TPM2P07951 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
TPM2P07951 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
TPM2P07951 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
TPM2P07951 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
TPM2P07951 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
TPM2P07951 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
TPM2P07951 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
TPM2P07951 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
TPM2P07951 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
TPM2P07951 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
TPM2P07951 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
TPM2P07951 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
TPM2P07951 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
TPM2P07951 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
TPM2P07951 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
TPM2P07951 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.8 ms